химический каталог




Молекулярная биофизика

Автор М.В.Волькенштейн

(белковые цепи длиною до 100 звеньев):

R4 /NH2 XT

и/ \юон

где R — какой-либо радикал — углеводородный или содержащий, помимо С и Н, другие атомы, например О, S, N. Приведенная

Канонические аминокислотные остатки

Название остатка и аминокислоты

Обозначение остатка

Краткое обозначение

Структурная формула

I. Нейтральные остатки

Глицил Глицин

Гли (Gly)

—СО—сн2

I

NH

Аланил Алании

Ала (Ala)СО—СН-СНз I

NH

Валил В а лин

Вал (Val)

V

—СО—сн—сн

I

NH

^СНз

Лейцил Лейцин

Лей (Leu)

—со—сн—сн2—сн:

NH

чсн3

/СН2—сн3

Изолейцил Изолейцин

Иле (Не)

—со—сн-сн:

I

NH

чсн3

Фенилаланил Фенилаланин

Фен (Phe)

СН—СНсо-сн-сн / \ н=/

NH

Пролил Пролин

Про (Pro)СО—СН—СН2

I /

N СН/

8 Триптофанил Триптофанин.

Серил Серив

Три (Тгр)

Сер (Ser)

W

Н С

—СО—СН—СН2—С сх ^сн

I II II IСО—СН—сн2—ОН

I

NH

NH НСХ /Сх ^СН

I NH С

Н

S

а о

5

о

о

.он

10 Треочил Треонин

Тре (Thr)

—со—сн—сн;

I

NH

SCH3

11

Метионил Метионин

Мет (Met)

МСО- СН—~Н2—СН2—S—СНз

I

NH

X

s

S

га О * S га

01

S О © S Ы S

??

S

О О

о м

II. Кислотные остатки (в виде анионов) 15 Аспартил

Аспарагиновая кислота

Асп (Asp)

—СО—СН—СН2—COO" I

NH

Глутамил

Глутаминовая кислота

Глу I

NH

Тирозил Тирозин

Тир (Туг)

н н

С=ССО—СН—СН,—^с-о"

I \ //

f 5"g

здесь формула в сущности не точна. Ряд фактов свидетельствует о том, что в нейтральной среде аминокислоты являются дипо-лярными ионами, или цвиттерионами (см. стр. 67)

R\C/NH*+ ш

н/ \coo~

При поликонденсации аминокислот в белковую цепь образуется пептдз^дная связь —NH—СО— и выделяется вода (см. стр. 118JTT

Все природные белки строятся, как правило, из'двадцати канонических аминокислотных остатков, приведенных в табл. 2.1. Из них 19 — действительно аминокислотные остатки, но Про — остаток иминокислотный, соответствующий иминокислоте про-лину. Остатки цистеинила (Цис—SH) в белке часто попарно соединяются друг с другом ковалентной дисульфидной связью, образуя Цис—S—S—Цис.

Двадцать остатков содержат двадцать различных радикалов R. В табл. 2.1 остатки разделены по электрохимическим свойствам.

Если классифицировать их по химическому строению, то мы убедимся в большом разнообразии остатков. Перечислим их.

A. Алифатические аминокислотные остатки (15): Ала, Apr,

Асп, Асн, Вал, Гли, Глу, Глн, Иле, Лей, Лиз, Мет, Сер, Тре, Цис

(Цис—SH).

В том числе: а. Углеводородные остатки (5): Ала, Вал, Гли, Иле,

Лей. -on

б. Остатки, содержащие гидроксильную

группу: Сер, Тре.

в. Кислотные остатки (содержащиеСООН): Асп, Глу.

г. Остатки, содержащие амидную группу

..CQNH2:.Асн, Глн. . • ~"

д. Остатки, содержащие аминогруппу (основную): Apr, Лиз. V '•

е. Остатки, содержащие серу: Мет, Цис (Цис—SH).

Б. Аминокислотные остатки, содержащие п-электронные циклы: Гис, Тир, Три, Фен.

B. Иминокислотный остаток — Про.

Помимо 20 канонических аминокислотных остатков, в белках встречаются производные некоторых из них. Среди этих минорных остатков особенно важен оксипролил (Опро)

—СО—СН—СН2

1 \СН—ОН, N-CH/

§ 2.3. свойства электролитов

?1

так как он присутствует в значительном количестве в одном из универсальных белков животных организмов — в коллагене (см. § 4.10). В ряде ферментов фигурирует оксилизил (Олиз)

—СО—СН—сн2—сн2—СН—СН2—NH;

NH

ОН

В белках некоторых морских организмов присутствуют дийодти-розил, дибромтирозил и т.д. Многие неканонические аминокислоты (орнитин, а, у-диаминовалериановая кислота, а, 5-диамино-масляная кислота и т. д.) фигурируют не в белках, а в низкомолекулярных пептидах и участвуют в процессах метаболизма.

Все функциональное многообразие белков определяется многообразием последовательностей 20 аминокислотных остатков в полипептидных цепях. Разнообразие этих остатков определяется радикалами R; немногих типов таких атомных групп достаточно для обеспечения любых молекулярно-биологически.х процессов.

§ 2.3. СВОЙСТВА ЭЛЕКТРОЛИТОВ

Свободные аминокислоты и входящие в состав белков основные и кислотные остатки являются электролитами. Функционируя в водной среде, они диссоциируют на ионы. Рационально пользоваться следующим определением Бренстеда: кислота — молекула, от которой отщепляется протон; основание — молекула, присоединяющая протон. Сам растворитель — вода — выступает как кислота в реакции Н20 ^ Н+ + ОН- и как основание в реакции Н20 -f- Н+ ^ Н30+ (ион оксония).

Вода — чрезвычайно слабый электролит, ее константа диссоциации очень мала. При 25°С в чистой воде, т.е. при [НгО]= 1,

[Н+] [ОН"] = К [Н20] = Ю~14 (моль ? л"1)2Так как [Н+] = [ОН-], концентрация водородных ионов в воде составляет 10~7. Удобно пользоваться отрицательным десятичным логарифмом этой величины, обозначаемым рН. Для воды, т. е. для нейтральной среды рН — 7. Соответственно, для кислот рН < 7, а для оснований рН > 7.

Биологические электролиты обычно слабые, иными словами, они м

страница 22
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228

Скачать книгу "Молекулярная биофизика" (4.80Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
pzw 60-35w2/2
баннер 8 марта
King Cutter
олег митяев 18 февраля 2017

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(23.01.2017)