химический каталог




Молекулярная биофизика

Автор М.В.Волькенштейн

единичной ячейки а = 33,2, b = S6,l, f=161 А. Дифракционная картина вдоль оси а (но не вдоль оси Ь) характерна для двуспиральных нуклеиновых кислот. Отсюда, видимо, следует, что длины двуспиральных участков отвечают не менее, чем половине оборота спирали, т. е. содержат более 4—7 пар оснований. Эти результаты согласуются с моделью клеверного листа [63].

тРНК кристаллизуется в различных элементарных ячейках, разные кристаллические формы получаются при изменении условий кристаллизации.

З'-конец

Позднее Рич с сотрудниками провели полную расшифровку пространственной структуры Фен-тРНК на основе рентгенограмм с разрешением до 4 А [154]. Третичная ее структура состоит из двух спиральных сегментов, соединенных под прямым углом друг к другу так, что получается подобие буквы Г. Антикодоновая шпилька объединяется в одну спиральную систему со шпилькой, содержащей дегидроуридиловую петлю. Эта структура показана на рис. 9.10 (см. также [152]).

Компактная структура тРНК стабилизована горизонтальными и вертикальными взаимодействиями оснований. В их упаковке играют роль также гидрофобные взаимодействия и куло-новское отталкивание заряженных фосфатных групп. Исследования три-тиевого обмена и реакции формальдегида с молекулами тРНК показали наличие в структуре молекул стабильного двутяжевого остова (48 медленно

обменивающихся протонов, что количественно согласуется с моделью «клеверного листа»), окруженного основаниями, формирующими более лабильную третичную структуру [64].

Ионы Mg нейтрализуют отрицательные заряды фосфатных групп и обеспечивают наибольшую стабилизацию компактной структуры молекулы, которая в этих условиях приобретает характерную оптическую активность [65, 66]. Спектр КД тРНК имеет интенсивный положительный максимум при 2640 A (As ~ ~5,5), отрицательные максимумы 2960 (Ае = —0,35), 2330

(Де = —1,0)'и 2100 А (Ае 5,0); кроме того, при 1880 А

наблюдается интенсивный положительный максимум (Ае ~ 18), величина которого крайне чувствительна к структурным изменениям [67, 68]. Интенсивности полос 2640, 2100 и 2960 А также чувствительны к изменениям конформации тРНК [67—69]. У частично разупорядоченных молекул (низкая ионная сила, повышенная температура среды, отсутствие ионов Mg, присутствие органического растворителя) исчезает полоса 2960 А, уменьшается интенсивность полосы 2640 на 20—25%. а полосы 2100 А — на 50—55% [67, 70]. Разупорядочение структуры сопровождается сдвигом максимума 2640 А в длинноволновую сторону [71]. Этот эффект, а также исчезновение полосы 2960 А вызваны изменением взаимной ориентации пентоз и оснований и самих оснований друг относительно друга [70, 71]. Исследование температурной зависимости спектров КД тРНК показало наличие нескольких ступенчатых изменений конформаций молекул в процессе плавления и вновь подтвердило схему вторичной структуры типа «клеверного листа» (см. [70—73]).

Упорядочение структуры молекул тРНК сопровождается появлением гипохромизма (до 22%) [64], увеличением числа медленно обменивающихся протонов [74], уменьшением числа оснований, доступных для формальдегида [64] и различных нуклеаз [75], увеличением коэффициента седиментации и уменьшением характеристической вязкости. Полная стабилизация ионами Mg4-1" и Са+* происходит при отношении их концентрации к концентрации фосфатов 1 : 2 [70].

Плавление молекул тРНК в отсутствие ионов Mg имеет некооперативный характер, ширина интервала плавления (ДТ) примерно равна 55° [76]. Добавление ионов Mg делает процесс кооперативным (ДГ т 18°) и повышает температуру до 75—80э [76]. Теоретический анализ кривых плавления тРНК вновь подтверждает структуру «клеверного листа» [64, 77].

При нагревании молекул тРНК обнаружены изменения их структуры при температуре 30—40 °С, т. е. до начала плавления/ Эти изменения наблюдались по гидродинамическим характеристикам [78] и при исследовании поляризации люминесценции присоединенных к тРНК молекул красителей. Очевидно, что в молекулах тРНК еще до плавления остова появляются степени свободы, позволяющие отдельным фрагментам молекулы перемещаться друг относительно друга. Данные по поляризации люминесценции показали, что молекулы тРНК имеют в растворе форму эллипсоидов с соотношением полуосей 1 :4 [79].

Исследование миграции энергии между люминесцирующим основанием, находящимся в петле антикодона молекул Фен-тРНК, и хромофорами акридинового типа, ковалентно привязанными к акцепторному концу, позволило оценить расстояние между ними [80]. Оно оказалось больше 40 А. Изучение миграции энергии между молекулами акридиновых красителей, адсорбированными на молекулах тРНК, говорит в пользу компактной третичной структуры [81].

Антикодоновый триплет расположен в верхнем лепестке клеверного листа. Как правило, он содержит минорный нуклео-тид — инозин (И). Абрахам предложил для Фен-тРНК модели, имеющую столько же вертикальных взаимодействий, сколько и «клеверный лист», но в одной непрерывной двойной спирали с дефектами. Основной аргумент этой работы — необходимость

совместной упак

страница 209
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228

Скачать книгу "Молекулярная биофизика" (4.80Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
профнастил южно сахалинске цены
новая рига участок без подряда 70 км
zwilling кастрюли отзывы
купить ширму для комнаты в леруа

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(07.12.2016)