химический каталог




Молекулярная биофизика

Автор М.В.Волькенштейн

рН 4,2 на 10%, двуспиральные олигомеры — на 80% [113, 114]. При таком изменении протонирования (на 70%) ДЯцР = 2,2 ккал/моль. Учет этих поправок при р = 10~3 л/моль дает для N = 6, 7, 8, 9, 10 значения ДЯ, равные соответственно

10,0; 10,2; 10,2; 10,6; 11,4 ккал/моль. Дальнейший анализ показал, однако, что предположение о независимости р от Т не согласуется с опытом. Из эксперимента следует, что от Т не зависит ps. Учет этого обстоятельства дает значение ДЯ, независимое от N и равное 11,8 ±0,6 ккал/моль пар оснований. Величина ps составляет 3-104 л/моль.

Евдокимов и Варшавский исследовали плавление ДНК *в легкой и тяжелой воде в широком интервале значений рН — от 2 до 12 [115]. График зависимости 1 пл от рН имеет колокол ообр аз ну ю форму с плато при 80—85 °С (ДНК фага Т2) в интервале рН 4,5—8,5 и резкое падение Гпл при больших и меньших рН (при ионной силе 0,18—0,25). При нейтральных р*Н температуры плавления ДНК в Н20 и D20 совпадают. Отсюда следует, что водородные связи не определяют стабильность ДНК. В кислой области более устойчива Н-ДНК, а в щелочной — D-ДНК. Различна и зависимость температур плавления Н-ДНК и D-ДНК от ионной силы при низких ее значениях (~ 0,01). Этот эффект можно объяснить различиями в степени гидратации, меньшей в D20. Из экспериментальных данных получены следующие значения АЯ и AS: при 37% пар Г —Ц ДЯ = 8,0, AS = 23,0; при 40% ДЯ = 8,7, AS = 25,4; при 48% ДЯ = 9,5 ккал/моль пар оснований, AS = 27,4 э. е. Значения для Н20 и D20 практически совпадают.

В работе [116] калориметрическим и оптическим методами изучена кислотная денатурация ДНК, определяемая протониза-цией азотистых оснований. Установлено возникновение некоторой промежуточной конформаций ДНК, отличной как от нативной, так и от денатурированной.

Обзор теории переходов спираль — клубок в ДНК дан в работе [117].

§ 8.5. КИНЕТИКА ДЕНАТУРАЦИИ ДНК

Кинетика расплетания двойной спирали ДНК была впервые рассмотрена Куном [118] (см. также [6]). Как показал .Кун, если допустить что раскручивание (возникшее после разрыва связей между цепями) происходит в результате вращательного броуновского движения, то этот процесс потребует времени т, гораздо большего, чем наблюдаемое. Так, для ДНК с м. в. 3-106 раскручивание 450 витков спирали, что необходимо для полного разделения, требует 150 дней. Между тем т для ДНК с м. в. порядка 108 составляет около 1 мин. Кун считал, что раскручивание происходит на концах спирали, но не учитывал свертывания в клубки освободившихся цепей. Если отвлечься от их неизбежного перепутывания, то т для расплетания цепей, свертывающихся в клубки, получится существенно меньшим [6, 119]. Кун

рассмотрел разделение цепей, происходящее при сочетании вращательного теплового движения с поступательным, и получил для ДНК с м. в. 3-106 т = 58 сек, что также слишком много.

Лонгет-Хиггиис и Зимм учли вращательный момент цепи, создаваемый увеличением энтропии у разделившихся цепей [120]

Ф = 36757,3°—выраженный в радианах угол, на который нужно повернуть конец цепи для освобождения одной пары оснований. Скорость раскручивания, т. е. относительная угловая скорость двух половин спирали <о = Р/Ь, где Ь — коэффициент трения. Для спиралей с м. в. порядка 106 т оказывается порядка секунд. Эта оценка не учитывает необратимости развертывания и переплетания освободившихся цепей.

Фиксман рассмотрел одновременное действие куновского (диффузионного) и энтропийного механизма [121]. Крозерс также исследовал сочетание обоих механизмов, но учел возможность одновременного плавления в разных точках молекулы, а не только на ее концах [122]. Особый интерес представляет работа Фонга [123]. Перепутывание свободных цепей не должно возникать, если разрыв цепей происходит в средней точке спирали. Две ее половины флуктуируют независимо, половину времени они развертываются, половину — скручиваются вновь. Однако на начальных стадиях процесса ввиду плотной упаковки спирали вторичное скручивание невозможно и кинетическая энергия скручивания превращается в потенциальную, способствующую раскручиванию. Если произошло много поворотов, возможно обратное скручивание. Таким образом, две половины спирали беспорядочно скручиваются и раскручиваются без изменения радиуса спирали. Но скручивание не может продолжаться неопределенно долго, и поэтому при таком беспорядочном движении происходит преимущественно развертывание спирали. Число поворотов N(t) при / > 0, следовательно, меньше или равно начальному числу поворотов спирали N0. Задача состоит в нахождении т для условия

т

J со (г) dt = — 2nN0l (8,48)

о

где ш(г)—относительная угловая скорость двух половин спирали. Если N(t)—N0, то со(г_) = —

страница 187
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228

Скачать книгу "Молекулярная биофизика" (4.80Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
http://taxiru.ru/fotootchet_forum_taksi/
фурнитура для межкомнатных дверей цвет матовое серебро
дизайнерские шкафы металлические
стул one купить

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(20.09.2017)