химический каталог




Молекулярная биофизика

Автор М.В.Волькенштейн

я константы скорости медленной стадии имеет вид

AE±lA=_HP±bL^_KPi + h_^ (7>113)

к-,

—1

Ему отвечает одно время релаксации

к2

(7,114)

h

(7,115)

где K\, К2 — константы равновесия реакций связывания, т.е. образования F\ из Fo и S и F2 из Fo и Я,

K1 + F0+S + P

/Cj + FoH- S + PK1IK2 f _ K2 + F0 + S + PKilKx

K2 + Fo + S + P

Метод релаксационной кинетики позволяет определить все константы.

Если скорости всех стадий близки по порядку величины, ситуация усложняется. В этом случае оказывается целесообразным рассматривать усредненные значения т, также дающие ценную информацию о константах скорости [125, 127].

При малых концентрациях фермента реализуются стационарные значения концентраций промежуточных комплексов. Релаксационный спектр сводится к одному значению т, характерным образом зависящему от 5.

Таким образом, релаксационная методика дает возможность получения детальной информации о промежуточных комплексах и соответствующих константах скоростей.

Обратимся теперь к спектру времен релаксации для аллосте-рического белка, также исследованному Эйгеном [125].

Согласно теории МУШ (см. стр. 457) аллостерический фермент характеризуется тремя параметрами — константами связывания лиганда в R- и Г-состояниях и параметром, описывающим конформационный переход R +± Т. Соответственно система должна иметь не меньше трех временных постоянных. Предположим, что переход R *=*Т есть наиболее медленная стадия. Связывание субъединицами в /^-состоянии характеризуется одной наблюдаемой временной постоянной ть соответствующей реакции свободных молекул субстрата с незанятыми /^-центрами. В случае тетрамера для концентрации свободных связывающих центров в ^-состояниях имеем

Величина 1/tj должна быть функцией суммы S и фН. То же относится к Г-состоянию тетрамера, характеризуемому T2. Оба равновесия сопряжены посредством 5, тогда как центр в Г-со-стоянии реагирует с субстратом и изменение его концентрации влияет на более быстрое связывание центром в /^-состоянии. Релаксационный спектр n-мерного фермента был вычислен Эйгеном в предположении о постоянстве концентрации S (буфер) или более быстром установлении равновесия с /^-состоянием, чем с Г-состоянием, т. е. ят"1 <С т"1. Имеем

ФЛ = пЯо+'(л-1)Д1 + (я-2)/Ь+ ... +Rn-i (7,116) и при указанных условиях

Т«'=К (s + <РЯ) + *§. 4i = 2 (ns + ft«)

?*d-»№ + fcg), (7,117)

тГг' = k\ (S + fRт»т = " (kAS + hl\ (7-118>

где кА и ко — константы скорости ассоциации с лигандом и диссоциации, фт аналогично фд,

KR — константа связывания для /^-состояния.

Превращение R характеризуется одним временем релаксации Тконф, вообще говоря, зависящим от 5. При малых 5 нет связывания, и система находится в Г0- и ^-состояниях. При очень больших S центры насыщены и система находится в 7V и /^-состояниях. В этих двух случаях Тконф не зависят от S, но различны. Если состояние Г0 более стабильно, чем /?0, но, напротив, /?4 более стабильно, чем Т4, то получается S-образный переход от одного значения тКОнф К другому. При 5 = const имеем

dIiRi =-kfTRo + kToRTo-k?TR1+ki;RT1- ... (7,119)

dt

Как и выше, линеаризуем кинетические уравнения, вводя малые отклонения от стационарных концентраций 6Ro и т.д. Заменяя 8Ro на

1 + 6Rr/6R0 + (6#2/6/?j) (6Я,/бЯо) + • • •

и производя аналогичные замены для всех bRi и 6Tf, находим1 kRT + k*T (б/?'/5/?о) + kf (6JW) (^iW) + .. ?

тконф j + (bRJbRo) + (6tfa/6tf,) (6RJ&R7) + ...

*ог«+»Г«(аг,/дг0) + ...

1 + (бтубг0) + ... ' *'>1ZU' Расчет при 6S — 0 дает приближенное значение

конф

f{SIKT), (7,121)

(l + S/KT)a 1 (l+S/^)n_

где

el S \ VI T. n\

(n-i)\ i\ \KT

T 7*/? / 7*/? 7*

ai==ki /ко . При af -> 1 функция f(S/KT) принимает значение (1 -f SIKT)\

В предельных случаях находим:

если S/KT < 1, S/KR < U то x'l==klR + ftor,

если S/iCr< 1, 5//Ся> 1, то т"1 = к™ + kRT,

если 5//Сг> 1, SIKR-> 1, то т~'=л?* + *!Г.

Наличие первых двух релаксационных эффектов, для которых тг1 линейно растет с концентрацией, дает детальную информацию о связывании в обоих состояниях. Третье значение т укаЛИТЕРАТУРА

479

зывает на конформационное превращение. Если ТКОНФ переходит от одного постоянного значения к другому, то имеются лишь две конформации. Резкость перехода характеризует кооператив-ность. Киршнер исследовал релаксационными методами Ь-гли-церальдегид-3-фосфатдегидрогеназу (ГАФД) и действительно установил все отмеченные особенности релаксационного спектра в согласии с теорией МУШ. Эти данные не исключают, однако, альтернативной модели Кошланда и соавторов (см. стр. 460).

Недавно Шварц предложил теорию химической релаксации при кооперативных конформационных переходах в линейных биополимерах [128]. Исследована релаксация в переходах спираль—клубок в полипептидах на основе модели Изинга. Теория применима как к коротким, так и к длинным цепям. Показано, что конформационный переход контролируется наибольшим временем релаксации.

Очевидно, что именно и

страница 171
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228

Скачать книгу "Молекулярная биофизика" (4.80Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
купить горткнзии большой букет
сигнализация с автозапуском старлайн цена
учебная центр парикмахер универсал государственный
Нож универсальный Twin Cermax 130 мм

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(03.12.2016)