химический каталог




Молекулярная биофизика

Автор М.В.Волькенштейн

ами

G{U={k^ + k2)k7M и &2) = к3М{ка + к6).

После сжатия этих путей в точку получим графы с определителями

ка + к6 + кА, Di2) = к7М + kYS.

D

Поясним нахождение этих путей и деревьев графически (рис. 7.34). Пунктирными стрелками показаны пути из ES в ЯЛ?,

сплошными — определители подграфов, оставшихся после слияния путей в точку (деревья, направленные в слитый узел). Каждый такой подграф состоит из двух параллельных ветвей, величины которых складываются. Получаем

D

ЕМ

G{L)D{U + G'"D

(А2 + Ар) к7М {ка + А6 + к4) +

+ А3М(Аа + А6) (k7M + k,S),

Разложение по путям при вычислении DEM позволяет ограничиться только двумя членами вместо десяти по правилу Кинга

ЕМ~*

\к7М

I

I

Е

ЕМ

к7м

I

ES

?-—--EMS

kjS

Рис. 7.34. Нахождение путей и деревьев.

и Альтмана. Остальные определители находят аналогичным образом. Окончательно имеем

Р WBS + WEMS T (7I80)

UE + UES "Г UEM ^ UEMS

где

DE = (A„ + A5) k7 (Ap + k2 + k3M) + A4 (Ap + A2) (A6S + A7), DЈ5 = A,A7S (Aa + A4 + A6) + A4A6S (A8M + kxS), DEM = + Ap) A7M (Ae + A4 + A6) + A3M (Aa + A6) (k7M + AtS), ^ЈMS = M**eS (*p + *2 + *SM) + А^АзМ (A8S + A7).

Дальнейшее усовершенствование некоторых деталей метода, развитого в [97], было проведено в работе Фромма [101].

В многостадийной ферментативной реакции некоторые стадии могут идти быстрее, чем остальные. В соответствующих подграфах стационарной системы устанавливается квазиравновесие. Это позволяет упростить вычисление скорости [102]. Можно выделить подграф, соответствующий быстрому установлению равновесия, — часть графа, состоящую только из быстрых стадий и отделенную от остальных частей медленными стадиями. Если скорость образования фермент-субстратного комплекса значительно превышает скорость появления продуктов, то имеется лишь один подграф быстрого равновесия, содержащий узлы, изображающие комплексы. При расчете оказывается возможным пренебречь медленными стадиями, поскольку деревья, включающие эти стадии, имеют малые величины. Скорость реакции выражается через константы равновесия и константы скорости превращения фермент-субстратных комплексов в фермент-про-дуктные и наоборот. Если стадия превращения является лимитирующей, то концентрация комплексов определяется только константами равновесия. Оказывается возможным воспользоваться диаграммным методом [103, 104], представляющим дальнейшее упрощение метода графов. Диаграммный метод развит применительно к реакциям с одним и несколькими выходами (т. е. с несколькими комплексами, из которых получается продукт), детально разработаны правила, упрощающие расчет. Метод с успехом используется для ряда сложных реакций, в частности для реакций с участием изоферментов. Диаграммный метод, описанный в цитированных выше работах, имеет самостоятельное значение.

Механизмы быстрого равновесия могут быть однозначно восстановлены по экспериментальным данным о зависимости скоростей реакции от концентраций лигандов [105, 106].

Метод графов позволяет обобщить различные модели АСФ [65, 74, 75]. Все эти модели можно представить единым графом, который однозначно определяется по зависимости начальной стационарной скорости от концентраций лигандов.

Рассмотрим связывание одного лиганда несколькими центрами фермента. В простейшем случае двух идентичных центров граф быстрого квазнравновесного связывания субстрата с последующим медленным его превращением в продукт имеет вид

Е ^ ES ES2t (7,81)

здесь Ки К2 — константы квазиравновесия для быстрых стадий, к\, &2 — константы скорости для медленных стадий. Коэффициенты 2/i и 1/2 означают, что в первой стадии может быть занят один из двух свободных центров и освобожден один занятый, а во второй — может быть занят один свободный центр и освобожден один из двух занятых. В этих обозначениях получаем

ар k\K\S + kzKxKzS2 {7 R<>\

что эквивалентно (7,60). Граф (7,81) можно полностью и однозначно восстановить по зависимости u(S). Зависимость формы кривой от значений констант рассмотрена на стр. 456. Граф для фермента с четырьмя идентичными центрами содержит 16 узлов, однако старшая степень 5 в выражении для v не превышает 4. Поэтому эквивалентной граф с минимальным числом ветвей представляется цепью из четырех стадий связывания субстрата

EJhM+ES -М?+Е$2 -bM+ES3 UKtS> ES4. (7,83) Уравнение для скорости имеет вид

Различным моделям тетрамерного фермента, рассмотренным в [13] (тетраэдр, квадрат и Др.), соответствует это уравнение

EN *~ЈNX *~ ?ЯХЯ ENXH

^2 ^~^2Х F2X2 ^2ХЛ

Е ^?}х ^ ЕгХг Е}ХЛ у

Lf* ' ^1 }k( )х ^2 ^П

Ео х Fo^2 рохл

Рис. 7.35. Граф для системы с косвенной кооперативностьнх

с различными величинами констант. Такие модели можно представить единым графом (7,83), однозначно восстанавливаемым по экспериментальной зависимости v (S).

В общем случае п идентичных центров имеем

>/!»ES ES2

. itTn~' ESN\ (7.85)

Модель МУШ можно представить таким графом с определенным законом возрастания констант Кь Тем самым, эта модель эквивалентн

страница 167
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228

Скачать книгу "Молекулярная биофизика" (4.80Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
статус мамам в поддержку больного ребенка
ремонт арок ваз 2114
20AL00DJRT
шкаф сушка для обуви

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(22.08.2017)