химический каталог




Молекулярная биофизика

Автор М.В.Волькенштейн

ое согласие теории с опытом свидетельствует о том, что КД для полинуклеотидов определяется в основном ля*-, а не /гя*-переходами. На рис. 5.22 показаны кривые КД и АДОВ для ДНК и РНК [143]. Относительная малость этих эффектов объясняется взаимной компенсацией вращательных сил, отвечающих ряду полос.

§ 5.7. СПЕКТРОПОЛЯРИМЕТРИЯ БИОПОЛИМЕРОВ

Итак, для различных конформаций полипептидов графики АДОВ и КД различны (рис. 5.23). В табл. 5.7 [144] приведены характерные значения минимумов и максимумов на кривых АДОВ.

Таблица 5.7

Характерные величины АДОВ для разных конформаций L-полипептидов

Конформация Минимум, А Точка пересечения кривой АДОВ с осью абсцисс

<[А!]=0>. А Максимум, А

а-спираль 2320-2330 2240 1980-1990

1820-1840 1900

р-форма 2290—2300 2200 2050

1990 1960 2280 (малый)

Неупорядоченная 2380 (малый) —

* 2040—2050 1980 1890

Поли-Ь-пролии II 2100 2030 1940

Таким образом, измерение АДОВ дает сведения о конформаций системы. Очевидно, что КД дает более четкую информацию, так как он определяется лишь вращательной силой, соответствующей данной полосе. Чистая а-спираль характеризуется эллиптичностями [0] = 3300(еь — ев), равными для 2060 А —36 000, для 2220 А —38 000 и для 1900 А +71 000 [145]. Эти

три значения эллиптичности типичны для а-формы. Хорошей мерой степени а-спиральности является [0] для 2220 А, обозначаемая [0]222о. — остаточная эллиптичность для белка в неупорядоРис. 5,23. Графики АДОВ и КД для L-полипептидов в различных конформациях.

ченном состоянии. В работе [145] приведен ряд таких данных (табл. 5.8) (см. также [146]).

Таблица 5.8

Растворитель

[е]222>-ю<

Белок

КД для белков в различных условиях

Доля а-спиралей х

Лизоцим рН 7,0, фосфатный бу- — 1,30 (1,30- -0,29)/3,8 = = 0,27

фер

8М мочевина -1,26 (1,26- -0,29)/3,8 = = 0,26

5М гуанидин НО -0,29

0

2-хлорэтанол -3,0 (3,0- ?0,29)/3,8 = 0,7

Инсулин рН 7,0, фосфатный бу- -1,46 (1,46- -0,64)/3,8 = =?0,21

фер

8М мочевина -0,64 0

Гемоглобин рН 7,0, фосфатный бу- -3,1 . (3,1- -0,34)/3,8 = 0,72

фер

8М мочевина -0,34 0

Изучение КД позволяет определить содержание не только а-спиралей, но и р-форм и неупорядоченных звеньев в белке.

Для этой цели развит эмпирический метод [147]. Строятся графики КД для трех белков (рибонуклеаза, лизоцим И миогло-бин), для которых доли А- И р- И неупорядоченной форм х, у, z известны из рентгеновских данных. Составляют систему уравнений для трех белков

[e]i = *, [в]в + у, [в]р + (1 - хх - У1) [в]г,

[в]2 = х,[0]а + у2 [в]р + (1 - *2 - у2)[В]г,

[е]3=х, [в]а + Уъ [в]3 + (1 - хъ - #,) [в]г.

Из экспериментальных значений [6]ь [0]г, [0]з для любых Я и заданных значений х и у находим параметры [0]а, [0]р, [0]г для любых X. С помощью этого метода интерпретации КД были найдены значения х и у для карбоксипептидазы А и А-химотрип-сина, хорошо согласующиеся с результатами, полученными методом рентгенографии.

Более доступны конформационные определения по кривым ДОВ вне области собственного поглощения. Пользуясь уравнением Моффита, можно оценить долю А-формы ха как отношение измеренного значения bo к величине bo А-спирали

ха= ьМ=~ У630.

Вместе с тем константу а0 для частично спирализованного белка можно представить в виде

ак | о.

а0 — CLq -J- XqCLq ,

где alK определяется вращением, обусловленным самими аминокислотными остатками. Иными словами, для частично спирализованного белка

к2 fx2 к4 \

[М] = аоК л2 \2 +*a(fl? л2 \2 + bo и2 \2,2 )? (5,135)

,2 5 2 I ла1"0 -2 42 1 0 А 2 г2\

fu Л| \ Л — ЛД IЛ "О/

Разлагая первый член в ряд по (Х2 — xl) \ получаем

j 2 • п4 / Л2 я А

ак Л0 , »ак Л0 , „ / а Л0 , ,а А0

RWI „ак О . »ак *"и , „ а "О I .a

,2 А2 1 "О /-2 Л2Л2 I "a I -2 - 2 1 "0 2 ,242 /*

Л ЛД 1Л/Д ЛД| \ Л Л<Д (Л ЛД I /

(5,136)

Соответственно

х

° 6?~6даК 630 '

Обычно 6jK мало и лежит в пределах ±50. В работе [148] было применено иное выражение, не имеющее, однако, принципиальных отличий от приведенного.

Величине а% можно с достаточными основаниями приписать значение 630—650 град• см2? моль~]. Величина а*к находится из данных о ДОВ для денатурированного белка.

При построении зависимости [М] (Я2/^о~ 0 от (Л2/— l)

получается прямая линия с наклоном хлЬ*\ отрезок, отсекаемый на оси ординат, равен aJK -\- хаа*. Таким образом, ха можно

определить двумя независимыми способами. Следует отметить, что присутствие ароматических аминокислотных остатков сильно влияет на значения констант Моффитта.

[М]

Другой эмпирический способ определения ха основан на применении одночленной формулы Друде

К

л 2 п 2

(К — константа) в предположении о линейной зависимости АО от ха. Для ха — 0,4 А0 = 2680 А, для ха = 0,0 (клубок) AQ = = 2120 А.

Блоут и Шехтер предложили применять для определения ха двучленную формулу

страница 114
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228

Скачать книгу "Молекулярная биофизика" (4.80Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
мягкие кровати 180х200
бутылочки в челябинске
siemens vhg519l 15-5 купить в екатеринбурге
трезвый водитель вызвать

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(24.01.2017)