химический каталог




Биофизика

Автор М.В.Волькенштейн

зма» биологически бессмысленно, так как триплеты, не содержащие А и Т (А и У в мРНК), кодируют только Про, Apr, Ала и Гли, т. е. лишь 7s всех аминокислотных остатков.

Различные точечные мутации имеют различные вероятности. Фогель и Копун (1977) проанализировали 1293 замещения аминокислотных остатков в филогенетически связанных белках, объясняемые однократными замещениями нуклеотидов ху в ко-донах xyz. Замещения z не рассматриваются, так как из 61 • 3 =» = 183 замещений в осмысленных кодонах 7 ведут к терминальТаблица 8.6. Числа мутационных замещений х х' та у -»- ущ в кодонах РНК рли филогенетически связанных белков

х', у'

я, У —- А г ц У

А 237 114 60

Г 272 .—. 92 71

Ц 96 73 — 92

У 54 63 69 —

вым кодонам и 126 представляют собой тихие мутации. Найденные таким образом числа щ замещений х хг и у -*~ у' в кодонах РНК приведены в табл. 8.6.

Для того чтобы найти относительные вероятности таких мутаций, следует учесть некоторые различия между числами нук-леотидных замещений т(, которые могут наблюдаться в виде замещений аминокислотных остатков, согласно коду. Получаем табл. 8.7. Относительные вероятности замещений находятся по формуле

т.

(8.1)

Нормируя //; к 1, получаем табл. 8.8.

Замены нуклеотидов являются транзициями или трансверсиями,. Транзиции — замещения пурина на пурин и пиримидина на пиримидин А Г, Ц У, трансверсии — замещения пурина

Таблица 8.7. Числа принципиально наблюдаемых замещений mi

х х' и у у' в кодонах

х, у — А г ц У

А 30 28 27

Г 30 31 28

Ц 28 31 — 27

У 27 28 27 —

на пиримидин и наоборот А ^ Ц, A *t У, Г ^ Ц, Г У. Согласно табл. 8.8 вероятность транзиции р — 0,08, трансверсий 1 — р = = 0,32. Данные, относящиеся к 198 мутантам гемоглобина человека, дают несколько иные значения: р = 0,62т 1-/7 = 0,38.

Эти данные характеризуют два обстоятельства: истинные вероятности замещений нуклеотидов в ДНК и РНК ц выживаТаблица 8.8. Нормированные относительные вероятности замещений х ж', у у' в кодонах РНК по данным для белков

' х\ у' х, у А г Ц У

А 0,177 0,091 0,050

Г 0,201 — 0,067 0,057

Ц 0,076 0,053 — 0,076

У 0,045 0,051 0,057 —"

ние соответствующих мутантных белков. В последнее время были получены данные, относящиеся непосредственно к РНК,^-247 замещений. Соответствующие нормированные относительные вероятности представлены в табл. 8.9. Превышение вероятностей транзиции над вероятностями трансверепй сохраняется, но оказывается не столь значительным: /7 = 0,56, 1 — р = 0,44.

Имеется существенное различие в вероятностях замещений, найденных из первичных структур белков (табл. 8.8) и непосредственно из первичных структур РНК (табл. 8.9). В первом случае вероятности транзиций А Г существенно превосходят вероятности трансверсий и транзиций Ц У, во втором случае этого нет. Следовательно, замещения А ^ Г дают меньшую долю

Таблица 8.9. Нормированные относительные вероятности замещений

в РНК

?—У'

х, у —- А г Ц У

А 0,065 0,040 0,053

Г 0,117 —. 0,109 0,121

Ц 0,093 0,113 — 0,121

У 0,049 0,028 0,089 ?

леталей, чем другие замещения. Это объясняется тем, что аминокислотные остатки, связанные переходами А ^ Г, существенно ближе друг другу, чем связанные другими переходами. В самом деле, переходам А ^ Г отвечают наименьшие изменения гидрофобностей. Напротив, переходам Ц ^ У отвечают вдвое большие изменения. В табл. 8.10 приведены усредненные изменения гидрофобностей аминокислотных остатков при замещениях нуклеотидов в мРНК.

Таблица 8.10. Средние разности гидрофобностей аминокислотных остатков (в кДж/моль) при замещениях х ж', у -»- у' в кодонах мРНК

х, у А г ц У

А 2,94 4,97 5,10

Г 2,94

4,35 6,24

Ц 4,97 4,35 —. 5,69

У 5,10 6,24 5,68 —

Таким образом, мутации А4* Г наименее опасны для структуры и функции белка и им должен отвечать наименьший процент леталей. Истинные вероятности замещений характеризуются табл. 8.9. Они согласуются с квантовомеханическими расчетами энергий взаимодействия в разных парах азотистых оснований.

Мы рассмотрели мутации класса а (с. 282), приводящие к замене аминокислотного остатка. Обратимся к мутациям класса б, приводящим к обрыву белковой цепи. Таких мутаций, определяемых единичными замещениями нуклеотидов в кодонах. xyz, всего 23—9 замещений в х, 7 — в у и 7 — в z. Из 23 мутаций 18 являются трансверсиями и лишь 5 — транзициями. Меньшая вероятность трансверсий до некоторой степени снижает вероятность гибельной терминальной мутации.

Значения вероятностей точечных замещений в кодонах, приведенные в табл. 8.9, позволяют вычислить относительные вероятности терминальных мутаций. Эти значения приведены в табл. 8.11.

Таким образом, наиболее вероятны терминальные мутации в кодоне УГГ, кодирующем Трп. Из 9 мутаций этого кодона 2

Таблица 8.11. Относительные вероятности мутаций, ведущих к терминальвым кодонам УАА, УАГ, УГА

У А в ко

страница 109
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228

Скачать книгу "Биофизика" (6.44Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
CF236A
обрезание у взрослых
щелкунчик 2 в москве
кровати с подъемным механизмом 120 на 200

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(14.12.2017)