химический каталог




Биохимия. Том 1

Автор Л.Страйер

ронов в субстрате. При катализе карбоксипептидазой А молекула воды, активированная глутаматом-270, непосредственно атакует карбонильную группу расщепляемой пептидной связи; одновременно тирозин-248 отдает протон на NH-группу этой связи, и в результате происходит гидролиз.

РЕКОМЕНДУЕМАЯ ЛИТЕРАТУРА

С чего начать

Phillips D. С, 1966. The three-dimensional structure of an enzyme molecule, Sci. Amer., 215 (5), 78 90. (Великолепная статья о трехмерной структуре и механизме каталитического действия лизоцима.)

Lipscomb W.N., 1971. Structures and mechanisms of enzymes, Proc. Robert A. Welsh Found. Conf. Chem. Res., 15, 131-156. (Прекрасно иллюстрированное детальное обсуждение структуры и механизмов действия карбоксипептидазы А и ряда других ферментов.)

Структура и механизм действия лизоцима

Osserman E.F., Canfield R.E., Bey-chok S. (eds.), 1974. Lysozyme, Academic Press.

I mot о Т., Johnson L.N., North A.C. Т., Phillips D. C, RupleyJ.A., 1972. Vertebrate lysozymes. In: Boyer P. D.

(cd.), The Enzymes (3rd ed.), vol. 7, pp. 666-868, Academic Press. Dahlquist F. W., Rand-Meir Т., Rajtery M.A., 1968. Demonstration of carbonium ion intermediate during lysozyme catalysis, Proc. Nat. Acad. Sci., 61, 1194^1198. Rupley J. A., 1967. The binding and cleavage by lysozyme of N-acetyl-glucosamme oligosaccharides, Proc. Roy. Soc. (B) 167, 416-428. (Представлены результаты опытов по гидролизу в меченной 180 воде, а также значения G0 при связывании олигоса-харидов и скорости гидролиза лизо-цимов.)

Ford L.O., Jonhson L.N., Mackin P. А., Phillips D. С. Tjian R., 1974. Crystal structure of a lysozyme-tetrasaccharide lactone complex, J. Mol. Biol., 88, 349-371.

Роль напряженности структур при катализе

Pauling L.. 1948. Nature of forces between large molecules of biological interest, Nature, 161, 707-709. (Содержит предвидение о роли напряженно-с i и структур в ферментативном катализе.)

Wolfenden R., 1972. Analog approaches to the structure of the transition state in enzyme reactions, Acc. Chem. Res., S, 10 18.

Leinhard G. ?., 1973. Enzymatic catalysis and transition-state theory, Science, 180, 149-154. Secemski 1.1.. Lienhard G.E., 1971. The role of strain in catalysis by lysozyme, J. Amer. Chem. Soc., 93, 3549-3550. Schindler M.. Sharon N., 1976. A transition state analog of lysozyme catalysis prepared from the bacterial cell wall tetrasaccharide, J. Biol. Chem., 251, 4330-4335.

Warshel A., Levitt M., 1976. Theoretical studies of enzymatic reactions: dielectric, electrostatic, and steric stabilization of the carbonium ion in the reaction of lysozyme, J. Mol. Biol., 103, 227-249. (Приведены расчеты, показывающие, что электростатические факторы в большей мерс способствую! образованию иона карбония в молекуле лизоцима, чем стериче-ские.)

Структура и механизм действия кар-бокенпептндазы А

Quiocho F.A., Lipscomb W.N.. 1971.

Carboxypeptidase A: a protein and an

en7yme, Advan. Protein Chem., 25,

1-78. (Обзор данных рентгеноструктурного исследования тгого фермента. Даны атомные координаты.)

Makinen М. ИЛ, Yamamura К..

Kaiser Е. Т., 1976. Mechanism of action of carboxypeptidase in ester hydrolysis, Proc. Nat. Acad. Sci., 73, 3882-3886. (Представлены доказательства образования ковалентного промежуточного продукта ацетил - фермент при гидролизе эфиров.) Breslow К., Wernick D.L., 1977. Unified picture of mechanisms of catalysis by carboxypeptidase A, Proc. Nat. Acad. Sci., 74, 1303-1307. (Приведены данные о прямом гидролизе пептидных субстратов и высказано предположение о различии механизмов гидролиза зфиров и пептидов.)

Вопросы и задачи

1. Предскажите относительную

скорость гидролиза лизоцимом

следующих олигосахаридов (буквой G обозначен остаток N-ацетилглюкозамина, буквой М-остаток N-ацетилмурамовой кислоты) :

а) М-М-М-М-М-М

б) G-M-G-M-G-M

в) M-G-M-G-M-G

2. На основании данных, приведенных на рис. 7.18, предскажите, какие из участков связывания углеводов

на лизоциме (от А до F) окажутся занятыми

при образовании фермент-субстратного

комплекса со следующими олигосахаридами (сокращения те же, что и в задаче 1):

а) G-G

б) G-M

в) G-G-G-G

3. Предположим, что при синтезе

гекса-NAG гликозидный кислород между остатками САХАРОВ D и Е мечен

изотопом 180. Где окажется этот изотоп после гидролиза гекса-NAG лизоцимом?

4. Аналог тетра-NAG, содержащий —Н вместо —СН2ОН при

С-5 в остатке D значительно сильнее связывается с лизоцимом, чем тетра-NAG. Объясните, какие особенности структуры лежат в основе этой разницы в сродстве связывания.

5. Сопоставьте координационные

связи атома цинка в карбоксипептидазе А и атома железа в оксимиогло-бине и оксигемоглобине.

а) Какие атомы непосредственно связаны

с этими металлами?

б) Каким боковым цепям принадлежат связанные с металлом группы?

в) Какие другие боковые цепи в белках способны связываться с металлом?

6. Экспериментальные данные

в пользу прямого гидролиза

(рис. 7.29) пептидов карбоксипептидазой А были получены

страница 72
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113

Скачать книгу "Биохимия. Том 1" (6.46Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
Газовые котлы Viessmann Vitocrossal 300 CM3 115/105
neo+cosmo+extra
стол ht0989
уличный планшет с подсветкой

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(08.12.2016)