химический каталог




Биохимия. Том 1

Автор Л.Страйер

как при сдвиге рН в кислую сторону-протонированием аспартата-52. Лизоцим проявляет ферментативную активность только при условии, что глута-мат-35 находится в неионизированной

СН20Н СН20Н

I !

)с он \-н;С он с=о

NAG3 ЧС Г/ NAGF ХС С

NHCOCHJ NHCOCHJ

КАРБОИИААОЕ ПРОИЗВОДНОЕ ЛАКТОИНЫЙ АНАЛОГ

ТОТРА-NAG ТЕТРА-NAQ

Рис. 7.19. Кольцо D лактонного аналога тетра-NAG имеет конформацию, похожую на полукресло, и в этом отношении сходно с промежуточным переходным состоянием в реакции, катализируемой лизоцимом.

форме, а аспартат-52-в ионизированной.

5. Избирательная химическая модификация. Лизоцим сохраняет ферментативную активность, если все имеющиеся в нем карбоксильные группы, за исключением карбоксильных групп глутамата-35 и аспартата-52, подвергнуть этерифика-ции. Остатки 35 и 52 остаются немодифи-цированными, если этерификацию проводят в присутствии субстрата. При удалении субстрата аспартат-52 этерифици-руется (тогда как глутамат-35 остается неизменным). Модификация аспартата-52 приводит к полной инактивации фермента. Это подтверждает предположение о том, что строгая ориентация карбокси-лат-иона аспартата-52 необходима для

А В С D Е F

При обычных гидролитических реакциях этот промежуточный продукт реагирует с ОН .При трансгликозилировании в реакции используется вторая молекула углевода: ROH. Реакция трансгликозили-рования специфична, так как акцептор связывается в участках Е и F в щели активного центра. Более того, образующаяся гликозидная связь имеет (3-конфигура-цию, как и в субстрате. Таким образом, эти данные подтверждают правильность предполагаемой формы промежуточного продукта катализа.

лее Рис. 7.21. Существование промежуточного продукта гликозил-фермент подтверждается способностью лизоцима катализировать, хотя и медленно, реакцию транс! ликозилирования, NAG4 (показан красным) соединяется с промежуточным продуктом гликозил фермент (показан синим на рис. Б), и в результате образуется NAG6.

стабилизации образующегося в качестве промежуточного продукта иона карбония.

6. Трапсгликозилировапие. При добавлении к лизоциму тетра-NAG происходит медленное образование гекса-NAG и ди-NAG (рис. 7.21). Существование этой реакции, называемой трансгликозилирова-нием, подтверждает наличие одного из важных элементов предложенного механизма ферментативной реакции, а именно образования в качестве промежуточного продукта комплекса гликозил—фермент.

7.8. Карбоксипептидаза А: протеолитиче-ский фермент, содержащий цинк

Перейдем теперь к карбоксипептидазе А-пищеварительному ферменту, гидроли-зующему С-концевую пептидную связь в полипептидах. Особенно легко гидролизуются пептиды, в которых С-концевой остаток имеет ароматическую или большую алифатическую боковую цепь (рис. 7.22). Этот фермент интересен в том отношении, что по механизму катализа он принципиально отличается от лизоцима. Прежде чем перейти к подробному обсуждению механизма действия карбоксипеп-тидазы А, отметим два основных аспекта.

1. Индуцированное соответствие. Связывание субстрата сопровождается значительными изменениями структуры фермента.

2. Смещение электронов. В активном центре фермента содержатся атом цинка и другие группы, которые индуцируют перераспределение электронов в субстрате, облегчая тем самым процесс гидролиза.

Трехмерную структуру карбоксипепти-дазы А (рис. 7.23) при разрешении в 2 А

ННО НN—С—С—N—С—+ Н,0

I I I оR Н сн

Карбоксипептидаза А

Н Н С-R

.0

о+ +H,NН

IсI

оРис. 7.22. Реакция, катализируемая кар-боксипептидазой А.

получил в 1967 г. Уилльям Липском (W. Lipscomb). Фермент содержит одну полипептидную цепь из 307 аминокислот, имеет компактную форму, которую можно приближенно описать как эллипсом, i ную с размерами 50 х 42 х 38 А. 38 А. В ферменте -имеются области ос-спиралей (38%) и Р-складчатых слоев (17%). С белком прочно связан ион цинка, наличие которого необходимо для проявления ферментативной активности. Ион цинка расположен в углублении близко к поверхности молекулы, причем он образует координационные связи (в виде тетраэдра) с боковыми цепями двух гистидинов, боковой цепью глутамата и молекулой воды (рис. 7.24). Рядом с ионом цинка на ферменте имеется большого размера «карман», в который попадает боковая цепь концевого остатка пептидного субстрата.

Рис. 7.25.

H2N—С—NH! Arg 11 45

Схематическое изображение связывания глицилтирозина в активном центре карбокси-пептидазы А. Показан постулированный каталитически активный комплекс.

7.9. Связывание субстрата индуцирует большие структурные изменения активного центра карбоксипептидазы А

Представление о характере связывания субстратов с карбоксипептидазой А возникло на основе данных, полученных при изучении структуры комплекса этого фермента с гли-цилтирозином. Глицилтирозин - медленно гидролизуемый субстрат. Процесс его связывания (рис. 7.25 и 7.26) можно представить в виде пяти последовательных этапов.

1. Отрицательно заряженная концевая карбоксильная группа глицилтирозина

страница 69
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113

Скачать книгу "Биохимия. Том 1" (6.46Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
NLD.SKICER1312
Fissler Special
маленькая угловая прихожая
справка о соответствии конструкции дорожного знака

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(08.12.2016)