химический каталог




Биохимия. Том 1

Автор Л.Страйер

убстрата. Напротив, присоединение субстрата индуцирует переход от Т к R. Во-вторых, конформационный переход от Т к R в разных субъединицах фермента происходит не согласованно, а последовательно. Гибридной форме RT отводится важная роль в модели последовательного механизма. В модели согласованного механизма наличие гибридной формы RT исключается. Эта модель исходит из важной роли симметрии во взаимодействии субъединиц в оли-гомерных белках и потому предполагает ее сохранение при аллостерических переходах. Модель же последовательного механизма, напротив, построена на предположении, что субъединицы могут взаимодействовать, даже если они находятся в разных конформа-ционных формах. Наконец, различие заключается также и в том, что в случае согласованного механизма гомотропные взаимодействия всегда должны быть положительными, тогда как в случае последовательного механизма они могут быть либо положительными, либо отрицательными. Будет ли вторая молекула субстрата связываться с ферментом более или же менее прочно, чем первая, зависит от природы структурных переходов, вызванных присоединением первой молекулы субстрата.

Какая из моделей правильна? Для одних аллостерических белков хорошо подходит модель согласованного механизма, тогда как для других, по-видимому, применима модель последовательного механизма. Однако существует группа аллостерических

белков, к которым неприменимы обе модели. Предполагается, что эти белки имеют не два (R и Т), а более конформационных состояния. Соответственно для описания аллостерических свойств таких белков требуются более сложные модели.

6.19. Водородные связи, а также электростатические и вандерваальсовы взаимодействия

в фермент-субстратных комплексах

Обратимые молекулярные взаимодействия в биологических системах опосредуются си0

H2N

+H3N—GLY— ТУГ— {f\

Субстрат

лами трех типов. Складывание макромолекул в сложную структуру, связывание субстрата с ферментом, межклеточные взаимодействия, т. е. все молекулярные взаимодействия в биологических системах, осуществляются благодаря образованию водородных связей, а также связей, обусловленных электростатическими и вандер-ваальсовыми взаимодействиями. Эти три основных типа нековалентных связей различаются по своей геометрии, энергии и специфичности. Более того, хотя на них всегда сильно влияет присутствие воды, однако этот эффект проявляется по-разному. Рассмотрим подробнее каждый из этих основных типов связей.

6.20. Заряженные субстраты могут связываться с противоположно заряженными группами фермента

Заряженная группа субстрата может реагировать с группой фермента, несущей противоположный заряд. Сила такого электростатического взаимодействия определяется законом Кулона:

r2D '

где q1 и q2 - заряды соответствующих групп, г-расстояние между ними, О-диэлектрическая постоянная среды. Электростатическое взаимодействие наиболее сильно проявляется в вакууме (где D = 1) и наиболее слабо - в такой среде, как вода (где D = 80).

Примером электростатического взаимодействия может служить связывание гли-цил-Ь-тирозина с карбоксипептидазой А-протеолитическим ферментом, который отщепляет С-концевые остатки аминокислот. Отрицательно заряженная концевая карбоксильная группа дипептидного субстрата взаимодействует с положительно заряженной гуанидиниевой группой аргини-нового остатка на ферменте. Расстояние между этими двумя противоположно заряженными группами составляет 2,8 А;

Фермент

Аргинином* боковая цепь фермента

Такой тип взаимодействия называют также ионной связью, солевой связью, солевым мостиком или ионной парой. Все эти термины имеют одно и то же значение: электростатическое взаимодействие между противоположно заряженными группами. Между отрицательно заряженным субстратом и положительно заряженной боковой цепью лизинового или аргининового остатка могут возникать электростатические взаимодействия. Если величины рК имидазольной группы остатка гистидина или концевой аминогруппы полипептидной цепи обеспечивают их положительный заряд при данном рН среды, то они также могут функционировать как потенциальные участки связывания отрицательно заряженного субстрата. В случае если субстрат имеет положительный заряд, потенциальными участками связывания служат отрицательно заряженные карбоксильные группы аспартата и глутамата, а также концевая карбоксильная группа полипептидной цепи.

6.21. При связывании субстратов с ферментами образуются строго ориентированные водородные связи

Несмотря на то что многие субстраты не имеют заряда, они связываются с ферментами с высокой степенью специфичности и сродства. Основной вид взаимодействия таких субстратов, а также большинства заряженных субстратов с ферментами-это образование водородных связей. В водородной связи атом водорода связан сразу с двумя другими атомами. Тот атом, с которым водород связан более прочно, называют донором водорода, тогда как второй

Акцептор водорода

Донор водорода

Донор водорода

атом - акцептором водорода. По существу водородную связь можно рассматрив

страница 58
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113

Скачать книгу "Биохимия. Том 1" (6.46Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
подставка для телевизора акма pl4/2 bl
где можно обучится ремонту газовых котлов
ремонт холодильника Zanussi ZRB 35180 WА
ручка держатель на музыкальный гироскутер

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(09.12.2016)