химический каталог




Биохимия. Том 1

Автор Л.Страйер

^>1-N С

H,N—Gly—Asp--Phe—Arg—Gly- C.

Пептид, укороченный на один остаток

Cr

ФТГ-алаиин

Рис. 2.28. Деградация по Эдману, От пептидной цепи отщепляют меченый N-концевой остаток аминокислоты (ФТГ-аланин на первой ступени деградации). Остаток пептидной цепи при этом не гидролизуется. На второй ступени деградации определяют следующий N-концевой аминокислотный остаток. Еще три ступени деградации по Эдману позволят установить всю последовательность аминокислот во взятом пептиде.

н о

Н RT

Н 0

1 1! H 0

1 II

с—с -N- -c- -c~~

1

снг

1 z H

сн,

1 2

1

s

I

н оN—С—С-I I Н R,

Н

NIСн н2сх у

с

H3N

н о

! 11 -с—сI

«3

Метионин

Рис. 2.29. Бромистый циан расщепляет полипептиды по карбоксильной группе метиониновых остатков.

карбоксильным группам ароматических и других больших неполярных аминокислотных остатков. Пептиды, образующиеся под действием химотрипсииа, неизбежно перекрывают два или более триптических пептида, что используется для установления их последовательности. Таким путем полностью определяют последовательность аминокислот в белке.

Описанные методы применимы к белкам, состоящим из одной полипептидной цепи, не имеющей дисульфидных связей. В тех же случаях, когда в белке имеются дисуль-фидные связи или более одной полипептидной цепи, то необходимы дополнительные методические приемы. Например, если белок содержит две или более полипептидные цепи, соединенные нековалентными связями, то, воздействуя денатурирующими агентами, такими, как мочевина или гуанидинги-дрохлорид, вызывают диссоциацию цепей. Диссоциированные цепи разделяют и только после этого приступают к определению последовательности аминокислот в каждой из них. Если же полипептидные цепи соединены ковалентными дисульфидными связями, как это имеет место в инсулине, то их окисляют надмуравьиной кислотой; при этом дисульфидные связи разрываются и образуются остатки цистеиновой кислоты (рис. 2.32).

Анализ структуры белков удалось значительно ускорить путем создания секвенато-ра-специального прибора для автоматического определения последовательности аминокислот. При таком определении белок в виде тонкой пленки помещают во вращающийся цилиндрический сосуд, где он подвергается деградации по Эдману. РеакРеактив

Химическое расщепление

Бромистый циан

Гидроксиламин

2-Нитро-5-тиоцианобензоат

Ферментативное расщепление

Трипсин

Клострипаин

Стафилококковая протеиназа

Место расщепления пептидных связей, образованных:

Карбоксильной группой

остатков метионина Связь аспарагин—глицин Аминогруппой цнетеиновых

остатков

Карбоксильной группой остатков лизина и аргинина

Карбоксильной группой остатков аргинина

Карбоксильной группой остатков

аспарагиновой и глутамино-вой кислот (глутаминовой кислотой - только в определенных условиях)

но но НО

I II j II V

Н

Н RN-C-C-N-C-C-- N-C-CН R,

+ Н20

Трипсин

I

Н

НО Н С С—С—N—С—

I I Н R

Н О

H3N—С—СПизин или аргинин

Лизин или аргинин

Рис. 2.30.

Трипсин гидролизует полипептиды по карбоксильной группе остатков лизина и аргинина.

Триптический пептид

Триптические пептиды Химотриптический пептид Ala—Ala—Trp—Gly—Lys Val Lys—Ala—A!a—Trp Thr—Asn—Val—Lys

Триптичэский пептид

Thr—Asn— Val—Lys—Ala—Ala—Trp—Gly—Lys

* .

Перекрывающий химотриптический пептид

Рис. 2,31.

Пептид, образующийся при химотриптическом расщеплении, перекрывает два трипти-ческих пептида; благодаря это-му можно установить последовательность расположения пептидов.

N—НС—Н

Цистин

Н—N I

Н—С—СН,— S—S—СН,

С=0

о=с

!

о

II

н—с-О—О—Н Надмуравьиная кислота

Н—N

I

\

N—Н

Н—С—СН2—so3- -OJS—СН2—С—Н

о=с

С=0

\

I

Важную роль при этом играет последовательность аминокислот, так как в конечном счете именно она определяет конформацию белка.

В конце 30-х годов Л. Полинг (L. Pauling) и Р. Кори (R. Corey) начали проводить рент-геноструктурные исследования аминокислот и петидов. Они определяли стандартные длины и углы связей, с тем чтобы исходя из этих данных предсказать конформацию белков. Был обнаружен важный факт: пептидная единица обладает жесткой планарной (плоской) структурой. Водород в замещенной аминогруппе почти всегда занимает транс-положение по отношению к кислороду карбонильной группы (рис. 2.33). Связь между атомом углерода карбонильной группы и атомом азота пептидной единицы имеет частично характер двойной связи, и, следовательно, вращение вокруг этой (рис. 2.34) связи должно быть заторможено. Длина связи составляет 1,32 А-среднее значение между длинами одинарной связи С—N (1,49 А) и двойной связи C=N (1,27 А).

Пептидная группа

Цистеиноаая кислота

Рис. 2.32. Дисульфиды расщепляются надмуравьиной кислотой.

3-665

О

С- N

I

н

В отличие от рассмотренного случая связь между а-углеродным атомом и углеродным атомом карбонильной группы истинно одинарная. Следовательно, по обеим сторонам жесткой пептидной единицы вокруг этих

о

I +C = NН

Рис

страница 13
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113

Скачать книгу "Биохимия. Том 1" (6.46Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
Мебель для кабинетов Ego Zeroventiquattro Италия купить
обслуживание оборудования кинотеатров
продажа спортивных банкеток
оптовая база сантехники

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(24.01.2017)