химический каталог




Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот

Автор А.С.Спирин

ификаций. В другом варианте следят за тем какие химические модификации мешают белку присоединяться к ДНК. Используют различные химические реагенты, вызывающие в конечном итоге разрыв цепи ДНК в месте модификации (принцип регистрации мест разрывов объясняется на рис 861 В зависимости от используемого реагента можно ндентнфициромеченый, концевой нцклсотио

тип \ЛШ

•LLLLLLLLL I ГТТТТТТГ -3.1' I I И I I ?

контакты с фосфатными группами ДНК. метилькыми группами гуанина и аденина. выступающими в большую и малую бороздки, локализовать рас-тавгенные участки ДНК Если нанести на пространственную модель ДНК зарегистрированные таким образом контакты с бе.тком^они очертят площад-KV на которую садится белок, его «отпечаток, на ДНК (рис 86). В случае РНК-потнмеразы основные контакты группируются в районах «-оо» и «-10» что еще раз подчеркивает их функциональную значимость в связы9981

пШазй им J L химическая V мо/иашквиоя TIT-11ЧИ1ТП 1 I | ! I 1 I ? ? ? II I 1 ? ? ? 1 1 Т

ТГГТП*1ГГ "

11 ? ? ? 111 ? I ?1 '"?

11 ? ? 11111 ч ' | ? ? ? ?ТП

денатурация и \

электрофора >?

исходный

у paintнт ^

2 3 «

6

раОиоаОтогрйф Рис. 86. Локализация контактов белка с ДНК

143

вании РНК-полимеразы с промотором. Рассмотрение отпечатка РНК-полимеразы на промоторе показывает, что она покрывает всю поверхность ДНК на месте своего присоединения, оставляя на другой стороне ДНК свободное место для присоединения других белков как в районе с—35», так и в районе стартовой точки.

Простейший механизм репрессии заключается в стерическом блокировании репрессором присоединения РНК-полимеразы к промотору. Такой механизм имеет место в тех промоторах, в которых участок связывания репрессора перекрывается с участком связывания РНК-полимеразы. Простейший механизм активации заключается в том, что белок-активатор присоединяется к промотору рядом с РНК-полимеразой и за счет непосредственного контакта с ней облегчает образование открытого промоторного комплекса. Дискуссионными являются механизмы действия тех белков-регуляторов, которые присоединяются к ДНК на значительном расстоянии от РНК;поли-меразы. Ниже рассмотрено несколько наиболее хорошо изученных примеров, иллюстрирующих различные принципы регуляции промоторов.

Репрессор фага X

Репрессор фага X представляет собой димер из двух идентичных субъединиц. Молекула димера связывается с участком ДНК длиной 17 п. н. Субъединицы состоят из двух компактных доменов примерно одинаковых размеров, соединенных короткой перемычкой (всего в мономере репрессора 236 а. о). Перемычка легко расщепляется протеазами. N-концевой домен, полученный после расщепления протеазами (остатки 1—92), способен связываться с ДНК, однако менее прочно, чем интактный репрессор. Кроме того, изолированные Х-концевые домены легко диссоциируют до мономеров. Поэтому считается, что в непосредственном контакте с ДНК находится только N-концевой домен, а С-концевой домен стабилизирует связывание с ДНК за счет стабилизации димера.

В N-концевом домене имеется пять участков а-спирали. Первые четыре спирали вместе с соединительными участками; образуют компактную глобулу. Пятая спираль (нумерация идет от N-конца} выступает из глобулы и примыкает к пятой спирали другого мономера. За счет этого контакта N-концевые домены удерживаются в; димере. Из глобулы выступают также первые 8 а. о., образующих: вытянутую «руку».

Рассмотрение пространственной структуры сразу дает представление об общем характере взаимодействия репрессора с оператором. В димере два одинаковых а-спиральных участка 3 образуют выступающие кромки, расстояние между центрами которых составляет 3,4 нм, т. е. равно расстоянию между двумя соседними большими борсздками двойной спирали ДНК. а-Спирали репрессора наклонены так, что могут свободно войти в две соседние большие ба144 роздки оператора, в которых боковые радикалы ( с

аминокислотных остатков \ ( _|_

могут непосредственно кон- ( N

тактировать с химическими группами азотистых

оснований, выступающими

в эту бороздку. Спираль 2

располагается над бороздкой, и ее концевая часть

может контактировать с

фосфатным остовом молекулы. Гибкая «рука» репрес- ж.

сора (первые 8 аминокис- 'я* у

лот) обнимает молекулу Д.^; у/'

ДНК (рис. 87). Основную

рать в узнавании нуклео- M:^9ilL?'>

тидной последовательности yоператора играет спираль,

погруженная в большую

бороздку ДНК, а остальные контакты неспецифнчески стабилизируют связь

репрессора с оператором.

Наиболее убедительно об

этом свидетельствуют изя- - _ „_ „

щные опыты по направлен- Р,'с- ?' • РепР«С0Р Фага

r , 1 ~5 — номера а-спнралей

ному изменению специфичности репрессора фага 434, родственного фагу /.. Ген репрессора фага 434 был перестроен так, что аминокислотные остатки, расположенные на наружной поверхности а-спирали 3, входящей в большую бороздку оператора фага 434, были заменены на соответствующие аминокислотные остатки репрессора другого фага Р22. Аминокислот

страница 48
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот" (5.58Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
вешалка напольная с чехлом
led лампы ar111
детский спортивный комплекс для квартиры
мебель для ванной комнаты labor legno paris

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(27.03.2017)