химический каталог




Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка

Автор А.С.Спирин

вательностями. Уже отмечалось, что 5'-конец обычно модифицирован «кэпом» (см. рис. 5), имеющим, по-видимому, значение для первичной (преинициаторной) ассоциации мРНК с рибосомой. Здесь следует указать на возможную разницу в механизме поиска инициирующего

MET GLU THR ARG PHE PRO GLN GLN SER GLN GLN THR PRO ALA SER CAAGGUCUC С JJ_AA A A G AUG G А А А С С С G A U U С С С U С A G С A A U С G С A G С А А А С U С С G G С A U С GLN GLY LEU LEU LYS ASP GLY ASN PRO ILE PRO SER ALA ILE ALA ALA ASN SER GLY ILE

1678

THR ASN ARG ARG ARG PRO PHE LYS HIS GLU ASP TYR PRO CYS ARG ARG GLN GLN ARG SER

UACUAAUAGACGCCGGCCAUUCAAACAUGAGGAUUACCCAUGUCGAAGACAACAAAGAAG

TYR MET SER LYS THR THR LYS LYS

SER THR LEU TYR VAL LEU ILE PHE LEU ALA ILE PHE LEU SER LYS PHE THR ASN GLN LEU UUCAACUCUUUAUGUAUUGAUCUUCCUCGCGAUCUUUCUCUCGAAAUUUACCAAUCAAUU PHE ASN SER LEU CYS ILE ASP LEU PRO ARG ASP LEU SER LEU GLU ILE TYR GLN SER ILE

LEU LEU SER LEU LEU GLU ALA VAL ILE ARG THR VAL THR THR LEU GLN GLN LEU LEU THR GCUUCUGUCGCUACUGGAAGCGGUGAUCCGCACAGUGACGACUUUACAGCAAUUGCUUACU U A A ALA SER VAL ALA THR GLY SER GLY ASP PRO HIS SER ASP ASP PHE THR ALA ILE ALA TYR (LED

1902

Рис. 7. Нуклеотидная последовательность, кодирующая L-белок фага MS2, начиная с нуклеотидного остатка 1678: Аминокислотная последовательность L-белка указана над, а последовательности конца С-белка и начала S-белка под нуклеотидной последовательностью (по М. N. Beremand, Т. Blumenthal, Cell, 1979, v. 18, p. 257-266)

ко дона в прокариотической и эукариотической системах трансляции: прокариотические рибосомы ассоциируют с мРНК и узнают инициирующий кодон независимо от 5'-конца, и поэтому широко используют «внутреннюю» инициацию в полицистронных мРНК; в противоположность этому, эукариотические рибосомы обычно нуждаются в 5'-конце мРНК для ассоциации с ней, и «кэп», вероятно, способствует такой ассоциации (см. гл. B.VII). Считается, что в большинстве случаев в эукариотических системах первый AUG кодон от 5'-концаявляется инициаторным. 3'-конец эукариотических мРНК часто неопределенен: длина З'-концевой неко-дирующей последовательности может варьировать у разных молекул одной и той же мРНК. Кроме того, как уже отмечалось, подавляющая часть эукариотических мРНК несет на 3'-конце полиадениловые последовательности варьирующей длины.

Пространственная структура

Что касается пространственной (трехмерной) структуры мРНК, то, к сожалению, в настоящее время она не установлена ни в одном случае. Из измерений различных физических параметров некоторых мРНК ясно, что они представляют собой сильно свернутые структуры, с большим количеством внутрицепных взаимодействий между азотистыми основаниями типа Уотсон-Криковского комплементарного спаривания. Хотя мРНК не являются двойными спиралями типа ДНК, они обнаруживают развитую вторичную структуру за счет комплементарного спаривания отдельных участков одной и той же цепи друг с другом, с образованием большого набора относительно коротких двуспиральных участков. Около 70% всех нуклеотидных остатков в цепи участвует в комплементарном спаривании и, соответственно, в формировании внутримолекулярных спиралей. Большая часть двуспиральных участков образуется, по-видимому, за счет комплементарного спаривания смежных отрезков полинуклеотид-ной цепи; схема формирования таких коротких двойных спиралей дана на рис. 8. Комплементарное спаривание далеко отстоящих отрезков цепи должно приводить к дополнительному сильному складыванию структуры и формированию компактных доменов в мРНК, как показано на рис. 9. В основе этих взаимодействий, формирующих вторичную структуру мРНК, лежат спаривания А с U и G с С (Уотсон-Криковские пары), а также, по-видимому, G с U (см. рис. 19). О взаимодействиях, формирующих третичную структуру, и о самом характере третичной структуры мРНК ничего не известно.

В то же время имеется целый ряд указаний на роль вторичной и третичной структуры мРНК в трансляции. Уже отмечалось, что пространственная структура инициаторного участка мРНК может быть важной или даже решающей, чтобы триплет AUG (или GUG) мог играть роль инициаторного кодона. По-видимому, необходимо, чтобы собственно инициатор-ный триплет либо вовсе не был вовлечен в Уотсон-Криковское спаривание с другими нуклеотидами мРНК, либо участвовал в слабом (нестабильном) комплементарном спаривании. Другими словами, инициаторный кодон должен быть либо уже открыт, либо легко открываться для взаимодействия с инициаторной тРНК на рибосоме. Из предсказания вторичной

структуры на основании взаимной комплементарности смежных участков цепи следует, что неспаренный AUG триплет действительно имеется в начале цистрона белка оболочки фага MS2 РНК (рис. 10); этот триплет расположен как раз на верхушке дву-спиральной шпильки, образу

страница 9
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка" (3.76Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
дачи на новой риге у воды
стоимость шашки для такси
подголовники с мониторами и dvd для любого авто купить
проволока вязальная 1 2 мм цена

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(26.04.2017)