химический каталог




Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка

Автор А.С.Спирин

63-72.

Глава IV

ЭЛОНГАЦИЯ: ТРАНСЛОКАЦИЯ

1. ОПРЕДЕЛЕНИЕ И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ТЕСТЫ

Итак, в результате реакции транспептидации новоудлиненная пеп-тидил-тРНК занимает А-участок рибосомы, а деацилированная тРНК находится в Р-участке (рис. 108, слева). Другими словами, продукты реакции из рибосомы не освобождены и занимают положения, предназначенные для субстратов. Естественно, что в этом состоянии рибосома не способна осуществлять дальнейшую элонгацию.

Транслокацией называется внутририбосомный переход пептидил-тРНК из положения продукта реакции (из А-участка), где она не способна участвовать в транспептидации в качестве донора пепти-дила, в положение субстрата реакции (в Р-участок), где она опять сможет реагировать с другим, акцепторным, субстратом. Этот переход непосредственно сопряжен с освобождением второго продукта реакции, деацилированной тРНК, из рибосомы (из Р-участка). Транслокация сопровождается передвижением матричного полинуклеотида относительно рибосомы на один кодон и появлением компетентности к связыванию второго субстрата, аминоацил-тРНК (с вакантным А-участком).

Изменение функционального состояния рибосомы как результат транслокации схематически показано на рис. 108. Итак, пептидил-тРНК перемещается в Р-участок, деацилированная тРНК вытесняется из Р-участка, матрица передвигается на длину одного кодона и А-участок с новым кодоном оказывается вакантным.

В соответствии с вышесказанным, имеются четыре способа измерения транслокации, основанных на одном из следующих критериев: 1) реакция транспептидации с низкомолекулярным акцепторным субстратом —пуромицином; 2) связывание аминоацил-тРНК; 3) освобождение деацилированной тРНК; 4) передвижение матричного полинуклеотида.

1. Пуромициновая реакция — наиболее простой и распространенный тест. Как уже говорилось, пуромицин представляет собой низкомолекулярный аналог аминоацил-тРНК (см. рис. 89), служащий акцепгорным субстратом для пептидилтрансферазного центра рибосомы: аминогруппа его аминоацильного остатка атакует сложноэфирную группировку пептидил-тРНК (или ее аналога) как донорного субстрата, в результате чего между ними происходит реакция транспептидации, и пептидилпуромицин выпадает из рибосомы. Пептидил-тРНК в пост-Гранслокационной рибосоме реагирует с пуромицином, а в претрансло-Кационной рибосоме— нет. Отсюда, если пептидильный остаток мечен, то освобождение метки из рибосомы в ответ на добавление пуромицина свидетельствует о компетентности рибосомы к пуроми-циновой реакции, т. е. о нахождении пептидил-тРНК в Р-участке, и является количественной мерой посттранслокационного состояния в изучаемом препарате рибосом. Наоборот, некомпетентность к пуро-мицину говорит о претранслокационном состоянии частиц. » 2. Связывание аминоацил-тРНК также может служить количественной мерой транслокации (для тестирования удобно пользоваться меченой аминоацил-тРНК). Кодонзависимое связывание аминоацил-тРНК с транслирующей рибосомой непосредственно после реакции транспептидации оказывается невозможным; метка будет связываться *только после транслокации. Следовательно, неспособность к связыванию аминоацил-тРНК означает претранслокационное состояние рибосомы, а компетентность к связыванию аминоацил-тРНК характеризует посттранслокационное состояние.

3. Освобождение деацилированной тРНК из транслирующей рибосомы сопряжено с транслокацией. Поэтому, если остаток тРНК молекулы пептидил-тРНК, удерживаемой в рибосоме, мечен, то после реакции транспептидации метка будет еще обнаруживаться в рибосоме (деацилированная тРНК остается в Р-участке), и только транслокация будет освобождать метку в раствор. Поэтому для транслирующей рибосомы удержание деацилированной тРНК отражает претранслокационное состояние, а отсутствие деацилированной тРНК свидетельствует о посттранслокационном состоянии. Освобождение деацилированной тРНК из рибосомы в раствор является очень удобным количественным тестом для прослеживания хода транслокации в популяции рибосом.

4. Перемещение матричного полинуклеотида как тест транслокации наиболее сложен в техническом отношении. Он может быть или непрямым, когда основан на появлении компетентности к связыванию аминоацил-тРНК, специфической к кодону, следующему за ранее фиксированным в рибосоме, или прямым, если анализируется непосредственно изменение закрытого (защищаемого) рибосомой отрезка матрицы. В прямом тесте было показано, что сдвиг полинуклеотидной матрицы относительно рибосомы на один триплет нуклеотидов сопровождает появление компетентности к пуромицину и к связыванию аминоацил-тРНК.

2. УЧАСТИЕ ФАКТОРА ЭЛОНГАЦИИ (EF-G ИЛИ EF-2)

Транслокация катализируется довольно крупным белком, называемым фактором элонгации G (EF-G) у прокариот или фактором элонгации 2 (EF-2) у эукариот. Молекулярная масса EF-G — около 80000; он представляет собой одну полипептидную цепь длиной 701 аминокислотный остаток (в случае Е. coli), образующую несколько глобулярных доменов. Эукариотический EF-2 несколько крупнее EF-G; его молекулярная масса у млекопитающих

страница 82
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка" (3.76Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
http://taxiru.ru/galereja/
acet-1-1 цена
канальное оборудование вентиляции
купить наклейки с цифрами на ящики

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(22.09.2017)