химический каталог




Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка

Автор А.С.Спирин

ообще, белок S4 обнаруживает более или менее центральное положение в 30S субчастице (рис. 68).

3. ТОПОГРАФИЯ РНК

Иммунная электронная микроскопия

Вели привязать специфические гаптенные группы (например, динит-рофенильную или углеводную) к определенным местам рибосомной РНК или же получить антитела к модифицированным (минорным) основаниям ее, то можно с таким же успехом использовать иммунную электронную микроскопию для изучения топографии РНК на поверхности рибосомной частицы. Таким путем удалось локализовать прежде всего концы рибосомных РНК, к которым легче всего можно избирательно привязать ту или иную гаптенную группировку.

На 30S субчастице Е. coli местоположение 3 -конца 16S РНК было найдено в районе верхушки бокового выступа («платформы») или между «им и головкой (рис. 69, а и в). Приблизительно в том же районе был локализован т|А торцевой петли З'-концевой шпильки I6S РНК. S'-конец 16S РНК был локализован в районе тела 30S субчастицы со стороны, противоположной боковому выступу (рис. 69, б и в).

Рис. 69. Электронные микрофотографии рибосомных 30S субчастиц с антителами, присоединенными к модифицированным З'-концу 16S РНК (а) и 5'-концу 16S РНК (б), а также фотографии двух проекций модели 30S субчастицы с обозначениями местоположений 3'-конца 16S РНК (звездочка) и 5'-конца РНК (кружок) (в) (предоставлены В. Д. Васильевым, Институт белка АН СССР, Пущино)

На -50S субчастице Е. coli место выхода З'-конца 23S РНК на поверхность (и, следовательно, по-видимому, обоих ее концов) было найдено в районе основания L7/L12 стержня с внешней (обращенной от 30S субчастицы) стороны (рис. 70,6 и в). (Этот участок, вероятно, соответствует обоим концам 23S РНК, так как они, согласно современной модели вторичной структуры, замкнуты друг на друга в двойной спирали.) 3'-конец 5S РНК был локализован на головке (центральном протуберанце) 50S субчастицы (рис. 70, айв), что определило и локализацию всего 5S РНК-белкового комплекса, включающего белки L5, L18 и L25.

Привязка к топографии белков

Зная топографию белков и места посадки белков на первичной (и вторичной) структуре рибосомной РНК, можно, таким образом, вывести более или менее приблизительную топографию белоксвязы-вающих участков РНК на рибосомной частице. Естественно, что она будет просто повторять локализацию соответствующих рибосомных белков. Так, в районе белка S4 (рис. 68) должна локализоваться составная шпилька, включающая спирали 20—21 домена I, а также спираль 2, являющаяся черешком (спаренные 5'- и З'-концы домена) всего домена I (рис. 42). Фактически это — центральное место в

пространственной структуре 16S РНК, от которого расходятся все три ее главных домена; очевидно, что на морфологической картине |>образной РНК (рис. 49 и 50) это соответствует району бифуркации. Г В районе белка S8 (рис. 68) локализуется составная спираль 25—26 домена II (рис. 42). Так как белки S8 и S4 располагаются близко друг к другу (см. предыдущий раздел, а также рис. 63), то и составная спираль 25—26 домена II должна располагаться где-то в соседстве со шпилькой 20—21 домена I (как и показано схематически на рис. 42).

Наоборот, про белок S7, его непосредственных соседей (белки S9 и S13) и их окружение (белки S10, S14 и S19) известно, что они образуют группу, удаленную от центрального белка S4. Соответственно, узловой район домена III 16S РНК (куда сходятся спирали 39, 40, 52 и 55), связывающий белок S7, должен быть удален от черешка домена I и от бифуркации Y-образной РНК.

Говоря в общем о топографии главных доменов 16S РНК и их соотнесении с главными морфологическими долями рибосомной 30S субчастицы (тело, боковой выступ и головка), можно исходить как раз из известных фактов о размещении белков на РНК и на 30S субчасти-Це. Эти факты следующие. 1. Белки S4, S16, S17 и S20 связаны с 5'-концевым доменом I и в то же время обнаруживаются, как и сам 5'-конец РНК,

на теле 30S субчастицы. 2. Белки S8, S15, S6, S18 взаимодействуют с серединным доменом II 16S РНК, а на морфологически видимом изображении 30S субчастицы они локализуются либо непосредственно на ее боковой доле («платформе»), либо на стыке боковой доли и тела. 3. Группа белков S7, S9, S10, S13, S14 и S19 прикреплена к 16S РНК в районе ее 3'-проксимального домена III, а на 30S субчастице все они — типичные компоненты ее головки. Отсюда можно утверждать, что три главных структурных домена 16S РНК в общем соответствуют трем главным морфологическим долям 30S субчастицы: 5'-концевой домен I формирует ядро тела субчастицы, серединный домен II вносит вклад в образование бокового выступа («платформы»), а 3'-проксимальный домен III заполняет головку субчастицы. По-видимому, самый 3'-концевой участок 16S РНК (включая спирали 57,58 и 59) простирается от основания головки («шеи») к верхушке боковой доли («платформы»), как об этом свидетельствуют данные иммунной электронной микроскопии по локализации 3'-конца и 3'-концевой шпильки (рис. 69). Схематически соответствие доменов 16S РНК и морфологических долей 30S субчасти

страница 45
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка" (3.76Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
боковой удар арки заднего крыла видео выпремить
купить кроватку с ботиком из массива
заказать легковой автомобиль с водителем
багет для телевизора на стену

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(20.10.2017)