химический каталог




Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка

Автор А.С.Спирин

p>Из данных по доступности нуклеазам и химическим реагентам следует, что большая торцевая петля спирали III и нерпаренный район между спиралями II и III, а также «плохо спаренные» остатки составной спирали IV—V, не просто развернуты, а довольно сильно структурированы; предполагается их участие в организации третичной структуры 5S РНК, которая пока не известна.

Интересно, что торцевые и боковые петли часто характеризуются более консервативной первичной структурой, чем спиральные участки. Большая торцевая петля спиральной шпильки III содержит полуинвариантную последовательность:

И И CCGAVC,

А А

непосредственно примыкающую к спиральному участку (у всех прокариот она CCGAAC, у растений CAGAAC, у грибов CCGAUC, а у позвоночных животных CUGAUC). Ее тетрануклеотидная часть ОАдС, примыкающая к спирали, недоступна нуклеазам, т. е. по-видимому, структурирована. Через четыре остатка от нее по направлению к 3'-концу имеется полуинвариантная двунуклеотидная боковая петля —чаще всего АА, но у грибов UA, ФА или СА (СА также у некоторых высших растений). Характерно, что эта петля всегда фланкирована двумя G, которые спарены в противоположном тяже с двумя смежными С, обеспечивая, по-видимому, скрепление двойной спирали в месте петли. Далее через три остатка по направлению к 3 -концу всегда присутствует еще инвариантный дуплет АА, теперь уже в неспиральном районе, между спиралями II и III.

В спирали II, в ее З'-тяже, г

почти всегда имеется ин- , ioccGua го си

(а)

L(yQ- G С то

G - С

A- G

s u- А

G- и

A- G

100 G G

A- и

G- А

c- G

G • U 80

G

A- и

С' G

С' ? G

с ? G

90 С ? G

и и

вариантная однонуклеотид- pUGC?Y??CG'G GCGCG?UG ная боковая петля-у про- houacggaccg^c ^0<^у«свсд кар йот и грибов, как правило, А (у архебактерии может отсутствовать), у растений — U, у животных — С; за ней всегда следует G, спаренный с С противоположной цепи.

4. СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ И КОМПАКТНАЯ САМОУКЛАДКА МОЛЕКУЛ РНК

Прочное спаривание 5'- и

3'-концевых участков цепи i п

является, по-видимому, ха- PUUUCGUGGCSaUagcgaaga°ggU

д G V

G •с

у G •с

А ? G то

и •А

loo G • и

А • G

G G

А • и

G ? А

и • G

(у G • и,

и и

С ' G so

с ? G

90 С ? G

с • G

с -G

и U

1 J

рактерным свойством ста- hoGaACcgccgc cgcuucuc

бильных структур РНК. т VC°X 60 G а

(б)

Образование такой черешковой спирали завершает сворачивание пространственной структуры и фиксирует ее. В принципе фиксация концов должна неизбежно приводить к стабилизации внутренних спиралей и других типов укладки. Замыкание концов друг на друга вносит еще и дополнительный вклад в компак-тизацию структуры.

с

ТРНК ЯВЛЯЮТСЯ первым picccACCCG^SuGAGCGG*

0uuuggguggguc^ _cacucgcc

°I2S ИОд7 G G eoG

(6)

A- и

no A • U 70

U- А

С ? ? G

A' ? и

V C' G

C' G

C' G

C' ? G

G ? •С

A С

iooC' ? G во

G ?и

С ? G

С- G

_ и •А

'-v А ич-д

G ? Z"

G' ?С

А G

GU90

известным примером такой организации. Из предыдущего раздела видно, что рибосомные 5S РНК тоже имеют прочную черешковую спираль, образованную 5'- и 3'-концами ее цепи и, очевидно, фиксирующую ее общую укладку. В высокополимерных рибосомных РНК существование прочной (совершенной и достаточно длинной) спирали, образованной удаленными

(r)

A A

pGGAUGCGAU HOUCCUACGUUG

НЕ

no U

G С U

} C С

и

G

100 A A

G G G

i U С

G"

с и с

90 С A G G U

A A A G_

С С А

С » и U

ACCGGA С

UGGCCUr А G д AU АА

участками цепи, может служить верным признаком относительно независимой, компактно свернутой структуры участка цепи между ними. Такие самозавершенные структурные домены, с прочным спариванием их 5'- и 3'-концов, являются важнейшим конформаци-онным мотивом обеих высокополимерных рибосомных РНК.

16S (18S) РНК

UCUACCAG А99?УУ U

AGAUGGUC UGGCAA c

? V » 6aa"aVu Cua«

С

U то G

Й

A G U A

G so U G

LAU,

30

GCCCGA CGGGCU

G U„

U С

,11 40

го A uc

U

А А

А-Д

CCACCCUG GGUGGGACU А

с

С

и

G то G LU А' G U А G • С G • U U U во С • G

G G G

G А

Молекула как 16S РНК прокариот, так и 18S РНК эукариот может быть подразделена на 3 главных домена: 5'-концевой (домен I), ограниченный и скрепленный черешковой спиралью из 10—11 нуклеотидных пар (спираль 2, образованная последовательностями 27— 37 и 547—556 в случае 16S РНК Е. coli, см. рис. 42); серединный (домен II), имеющий черешок из 7 нуклеотидных пар (спираль 22, образованная последовательностями 564—570 и 880— 886 у Е. coli)\ 3'-проксимальный (домен III), ограниченРис. 48. Нуклеотидные последовательности рибосомных 5S РНК (V. A. Erdmann, Nucleic Acids Res., 1981, v. 9, p. г25-г42) и их вероятная укладка во вторичные структуры у представителей шести главных ветвей эволюции: а — граммотрицательная бактерия (Escherichia coli); 6 — граммположи-тельная бактерия (Bacillus subtiiis); в — архебактерия (Sulfolobus acidocalda-riu

страница 34
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка" (3.76Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
ремонт холодильников шарп на дому москва
диспетчеризация демо
уход за линзами по 60 мл + 8 таблеток
запуск чиллеров ciat

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(22.09.2017)