химический каталог




Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка

Автор А.С.Спирин

концевой части бактериальной 23S РНК (см. раздел 4 этой главы).

5S РНК

Полные первичные структуры 5S РНК как прокариот (Е. coli), так и эукариот (человек) были определены задолго до работ по структуре высокополимерных рибосомных РНК, еще в 1967 г. (в группах Ф. Сэнгера и С. М. Вейсмана, соответственно). С тех пор стали известны многие десятки первичных структур 5S РНК из рибосом

28S РНК

к З'-концу 28S РНК

5,8 S РНК

5'-конец 28S РНК

и

G IO-A С U С С А G С G

рС

G С С U G

и [с]

с

и

G

А-во

U С G С

U

u0„

[C0H]

3-конец 5,8S РНК

Рис. 46. Нуклеотидная последовательность и схема вероятной вторичной структуры рибосомной 5,8S РНК эукариот (животных):

за основу взята последовательность 5.8S РНК млекопитающих (по R. N, Nazar et al. J. Biol. Chem., 1975, v. 250, p. 8591-8597); в скобках даны замены или вставки нуклеотидов, которые могут наблюдаться в 5,8S РНК других таксонов животных — птиц, рептилий, земноводных или рыб (V. A. Erdmann, Nucleic Acids Res,, 1981, v. 9, p. г25-г42); показано возможное комплементарное спаривание 5,8S РНК с 5'-концевым доменом рибосомной 28S РНК мыши (по Т. A. Walker et al. J. Biol. Chem., 1983, v. 258, p. 333-338)

самых различных организмов. Это позволило проводить их сравнение как для выявления путей молекулярной эволюции и филогенетического родства таксонов, так и для проверки предсказываемых вторичных структур на основе гомологичных замен нуклеотидов.

Рис. 47. Обобщенная схема вторичной структуры рибосомной 5S РНК:

пять спиральных участков молекулы 5S РНК обозначены римскими цифрами

5S РНК, как правило, не содержит посттранскрипцион-но модифицированных (минорных) нуклеотидов. Однако у ряда видов дрожжей, а также у эвглены, имеется В очень редких случаях отмечаются другие минорные нуклеоти-ды — например, модифицированный С у архебактерии Sulfolobus acidocaldarius. Из сравнения нуклеотидных последовательностей 5S РНК различных таксонов особенно хорошо видно, насколько эволюционно консервативны рибосомные РНК. Так, человечья 5S РНК отличается от 5S РНК рептилий всего 2—3 нуклеотидными остатками, а от 5S РНК лягушек — 7—8 остатками. 5S РНК ржи отличается от таковой томата всего 2, а от 5S РНК фасоли —5 нуклеотидными остатками. Столь же близки между собой 5S РНК различных видов бацилл. Идентичны или содержат единичные нуклеотидные замены 5S РНК грамотрицательных бактерий, относящихся к кишечной группе и примыкающим родам {Escherichia, Salmonella, Aerobacter, Erwinia, Serratia, Proteus, Photobacter и др.).

Одновременно с определением первичных структур 5S РНК делались многочисленные попытки предсказать ее вторичную структуру. Тестирование однотяжевых участков с помощью нуклеаз и химических агентов, модифицирующих неспаренные основания, давало экспериментальную основу для этих попыток. Но решающим здесь все-таки следует признать сравнительный подход, основанный на укладке многочисленных известных первичных структур 5S РНК в однотипные вторичные структуры. Действительно, все известные первичные структуры 5S РНК можно уложить за счет самокомплементарности их участков по схеме, показанной на рис. 4? (схема обобщает принципиально похожие модели вторичной структуры, предложенные рядом авторов). На рис. 48 даны конкретные первичные и вероятные (предсказанные) вторичные структуры 5S РНК шести представителей главных царств (эволюционных ветвей) живого мира — грамотрицательных бактерий (Е. coli) (а), грамположительных бактерий (Bacillus subtilis) (б), метабактерии, или архебактерии (Sulfolobus acidocaldarius) (в), растений (Secale cereale) (г), грибов (Saccharomyces cerevisiae) (д) и животных (Homo sapiens) (е).

Прежде всего, в 5S РНК 5'-концевой участок цепи комплементарен З'-концевому участку и образует с ним прочную длинную двойную спираль из 9—11 пар нуклеотидов (спираль 1). Вся внутренняя нуклео-тидная последовательность укладывается в две составные шпильки. Одна составная шпилька четко разделяется на два двуспиральных участка — собственно шпильку из 6 пар нуклеотидов с большой торцевой петлей из 11—13 остатков в районе 40-го нуклеотида (спираль Ш) и двуспиральный участок из 7—8 нуклеотидных пар (спираль 11), соединенный с предыдущей спиралью некомплементарным районом. Другая составная шпилька с маленькой торцевой петлей из 2—4 нуклеотидных остатков представляет собой почти непрерывную двойную спираль, но, как правило, содержащую несколько дефектов, таких как неканонические пары, выпетливающиеся нуклеотидные остатки и, часто, неспаренные нуклеотиды в середине; поэтому она обычно может быть разбита на две подспирали (спираль IV и спираль V).

Общие особенности вторичной структуры 5S РНК те же, что были отмечены для высокополимерных РНК (см. раздел Б.11,3). Особо следует подчеркнуть встречаемость таких неканонических. пар, как G • U и G • А. Кроме того, во всех внутренних спиралях (II—V) часто встречаются однонуклеотидные и двунуклеотидные боковые петли; в большинстве случаев выпетливаются А, но бывают и другие остатки.<

страница 33
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка" (3.76Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
ноубук в прокат в москве
Рекомендуем фирму Ренесанс - лестница на мансарду купить - качественно и быстро!
кресло престиж цена
контейнеры yf dhtvz htvjynf

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(09.12.2016)