химический каталог




Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка

Автор А.С.Спирин

минорных остатков эволюционно консервативны и наблюдаются у других бактерий. Интересно, что З'-концевая шпилька, включающая спираль из 10 пар нуклеотидов, оказывается инвариантной для известных 16S и 18S РНК, и два сблокированных т|А в торцевой петле шпильки также обязательно присутствуют как у прокариот, так и у эукариот.

Модифицированным остатком, а также нуклеотидным петлям спиралей приписывают важную роль в организации участков молекулы, узнаваемых белками, и в участии в функциональных центрах рибосомы.

23S (28S) РНК

Первичная структура рибосомной 23S РНК Е. coli также была установлена как ее прямым химико-энзиматическим анализом, так и путем секвенирования ДНК ее клонированного гена (рис. 44). Одновременно и некоторое время спустя были секвенированы также высокополй-мерные РНК большой рибосомной субчастицы ряда других организмов, а также хлоропластов и митохондрий, которые дали материал Для сравнительно-эволюционного анализа. Весь арсенал методов, примененный в случае 16S РНК, был использован для изучения вторичной структуры 23 S РНК, и были найдены принципиально те же закономерности и особенности. Схема модели вторичной структуры 23S РНК Е. coli дана на рис. 45. Как и в 16S РНК, около половины или более остатков цепи 23S РНК оказываются вовлеченными в двойные спирали. Всего можно насчитать несколько более 100 индивидуальных спиралей. Наиболее ярким отличием от 16S РНК является, по-видимому, комплементарное спаривание 5'-конца 23S РНК с ее 3'-концом; довольно стабильная совершенная двойная спираль из 8 пар нуклеотидов удерживает оба конца вместе, в значительной мере фиксируя общую свернутость цепи в конечную компактную структуру. Как и в 16S РНК, пары G • U не редкость в спиралях 23S РНК. Кроме того, в спиралях имеются пары G • А и,

GGUUAA6CGACUAA6CGUACACGGUGGAiXCrcUG№V3iUCAGAG

i i

50 100

AUAACCGGCGAJJUCCGAAIK^G^

i i

150 200

CUAAGIWCCCCGAG6AAAAGAMUCAAC

( i

250 300

GCGUCUGOV^CGCGCGAUACAGGGUt^^

i i

350 400

AAUAUGGGGGGACCAUTCUCC^^

i i

450 500

AAAAAGAACCUGAAACCGUGl^GUACAAGCAG

i i

550 600

CAAGGULiVWCCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAA^

650 700

GUUGAAGGUUGGGlJMCACIJMCllGGA

I r

750 800

GAWGCU^UUCUCCCCGAAAGOJAUUUAGGUAGC^

850 900

CCCGAUGCAAACUGCGMUACC^GAGAAUGUUAUG^

950 1000

AGGUCCCAAAGUCAiXGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCC^

1050 1100

UCACUGGUCGAGIXGGCCUGCGCG6AAGAUGUAACGGGGCUAA

i i

1150 1200

UGUAAGCCUGCGAAGGUGUQCUGUGAGGCAUGO^

1250 1300

ftAGACttAGGGUXCUGUCCAACGUUA^

i i

1350 1400

GUACUUGGUGUUCUiXGAAGGGGGGACGG

i t

1450 1500

GAAAAUCAAGGCUGAGGCSUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAACCAAC^

1550 1600

GUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAG«

1650 1700

AGGCACGCUWUIVUem*LI№G<^

1750 1800

AAACWBAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGC^

i i

1850 1900

ACGGCGGO»*AACW*AACGGiXCuAAGGUACCGA^

1950 2000

CGAGACtXAGUGAV^AUUWCUCGClft

2050 2100

AGCCUUGA^JGUAGGAUAGGU«5GAGGC

2150 2200

GUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGXUGGUGGGUAGUUUGA^

2250 2300

OJl^UCGGAOUJCAGGAGGUUAGUGCAAUG^

i i

2350 2400

UUCUCWVUGGAAGGGCCAIKGCUCAACGGAUAAAATtG^

2450 2500

Рис. 44. Продолжение

03Atf^«ЈUCAUCAeAUCC.XG<^^

2550 2600

CWUUCK^CCUAUCUGCCGUGGGCG^

2650 2700

№CCM-WACimXGGWOTWAAUGCi^^

2750 2800

GGGlTCUGAAGGAACGUUGAAGACl^

1 t

2850 2900

CCUU

Рис. 44. Нуклеотидная последовательность рибосомной 23S РНК Е. coli (по J. Brosius et al. Proc Nat. Acad. Sci. U.S.A., 1980, v. 77, p. 201-204; C. Branlant et al. Nucleic Acids Res., 1981, v. 9, p. 4303-4324)

более редко, некоторые другие неканонические пары. В спиралях встречаются одно- и двунуклеотидные боковые петли, чаще всего с А (но бывают и другие).

В качестве посттранскрипционно модифицированных (минорных) нуклеотидов 23S РНК Е. coli имеет Ч/ (3 остатка), Т (2 остатка), т6А (2 остатка), m'G, m7G, Gm, Cm и неидентифицированные производные U. Часть их сблокирована, как например, в последовательностях 745-747 (m1G4T)H 1911-1917 (ЧААСШАЧО, а часть рассеяна, но почти исключительно (кроме одного и одного Т) в однотяже-вых районах.

Как и в случае малых высокополимерных РНК, эукариотические 26S-28S РНК оказываются гомологичными, особенно по вторичной структуре, бактериальной 23S РНК, но имеют ряд крупных вставок. В 28S РНК млекопитающих, которая на 1500 нуклеотидов длиннее 26S РНК дрожжей, характерной чертой является существование ряда G + С-богатых сегментов, по-видимому, сильно структурированных и вставленных в эволюционно консервативные участки; иногда они образуют очень длинные спирали. Наиболее принципиальным отличием эукариотических рибосомных РНК большой субчастицы является существование 5'-концевого 160-нуклеотидного фрагмента в виде отдельной цепи 5,8S РНК (рис. 46). Однако эукариотическая 5,8S РНК так тесно встроена в структуру 28S РНК, будучи спарена с ней в стабильные спирали, по-видимому, в трех местах, что говорить о ней как о структурно самостоятельной молекуле не приходится. Действительно, 5,8S РНК образует сама и с 28S РНК вторичную структуру, подобную той, что выводится для ковалентно-непрерывной 5'-

страница 32
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка" (3.76Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
изгороди и заборы нижний новгород
Milli Обеденный стол ОС-68
tokio hotel москва 2016
стоимость газели на свадьбу

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(04.12.2016)