химический каталог




Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка

Автор А.С.Спирин

а), были немедленно предприняты и дали свои положительные результаты.

Прежде всего, можно более или менее определенно локализовать на первичной структуре РНК те нуклеотидные остатки или олигонук-леотидные районы, которые не участвуют в комплементарном спаривании и вероятнее всего представляют собой однотяжевые секции цепи. Эти районы особенно чувствительны к таким рибонуклеазам, как панкреатическая пиримидил-РНКаза А, грибная гуанил-РНКаза Ti, бактериальная РНКаза Si, и к модификации их оснований такими

©

G С G-C G

с <> @>

G А С LI

G С

U Ai*> U Д U й

7%^

Gu 1 Ci G ?- U (2г) l.uuOGCbUCC ja ,.т(1 S"

ill ,=u>" -»

uu>6

т)А CCCG ACGAGC GGAbGUCA д W UAACCCUAGG,. „ Uu. *

д 0 l4in 0 G LI А АЛ A

™ U A SG и

, , G и „

0 S ."" aCo

„ ,.GGGU UGCUCG S'"» "™ - "= ""S

G CUKJ .—,4..Я G 1 Ur—, G c С

Ч.'.Ч. C-G U ? G G

ПЮД . я» С A ~ofi с a«ftC C. CJ»'lE'» '""I'll"

'ugaTaau ccgJg* gacc.c?? cac'guoVu cu>« *,.)**

SACUUUUG О ОСА С CUGGUCC G U GUAC 0 » О 0 и' %? i-Cf

*> AA «ос у 1 JV^ "Oe/CjA 6"»

Q U-A

,-A 3 X

970 С (ifc

*A«*C

®

'ue« .ofs«ecct$C

"У С.Н Ч- " 1" - ТС A,

«;, д A BO M Ш » U GAAGACGtqCAUU UUACUC 0UЦШ6 \ ^

®

ij c GIAGAAGGAC GCUGAACGUACACAAuCCGGACGQCG" juuCAGCGG 06 AO u* AGG GAG U A A AG ц д v—'

UfiCLU^UULpUa UQQCG ОС C_y СДСОСбиб-С Й ® "°

° и'Л* И *'U.AA

0 *»se' Vg:"cc *-й™"Г»т1

„° .CV6G" V'e« 0-C ^

*c 44 \ 4 ® ®

U JTtfV д 4100. CL. и

WO.6* li' G^.4. Д-ичюГТЛ0» «*»'eej»°»

A ? А П^ГС A ?

С G *.. n _ U *o W

и™^~ил — "g, ; -1®

A" A„ \

6

0CCG.U ea-V

A ? U 0 г

«ои-А мое Л

ас и « *

1 1 A U'BI» W

ей

О ? С

G U G ? С

ГГ1 G-CGG [1]

LSJ чоА G ^

AGGUCAUCAAlJ CUUCCA^^

«цСвОШ GC^A G^AGjGOG ^

С С

С С G А

° A* UC°A,«

"Vo 5 ft1*, с ,A M%'cuco': co.*c<;euu4?cu*ceuc

4лСГАА 0 "г- С 6Й сСО°° nOCCGUIJUGULiAducisiUOUO

GGOUCC

ада u

— и

Рис. 42. Вероятная укладка нуклеотидной последовательности рибосомной 16S РНК Е. coli во вторичную структуру (схема двуспиральных участков) (по Н. F. Noller et al. Science, 1981, v. 212, p. 403-411; C. R.Woese et al. Nucleic Acids Res., 1980, v. 8, p. 2275-2293; P. Stiegler et al. Nucleic Acids Res., 1981, v. 9, p. 2153-2172; C. Glotz, R. Brimacombe, Nucleic Acids Res., 1980, v. 8, p. 2377-2395):

спиральные участки пронумерованы цифрами в квадратиках; шпильки — цифрами в кружках

химическими реагентами, как глиоксаль и кетоксаль (модификация неспаренного G), бисульфит (модификация неспаренного С), мета-хлор-пербензойная кислота (модификация неспаренного А). Такая локализация уже позволяет искать смежные взаимно комплементарные участки вдоль первичной структуры РНК, между ее чувствительными точками.

Далее, возможна прямая локализация спаренных участков цепи. Один из наиболее результативных подходов состоит в том, что после переваривания РНКазой, гидролизующей однотяжевые участки РНК, получающиеся двуспиральные фрагменты разделяются в электрофорезе сначала в неденатурирующих условиях (первое направление), а затем в условиях диссоциации двуспиральных комплексов (второе направление); таким образом, каждая полоса первого направления, представляющая собой двойную спираль, разделяется во втором направлении на два пятна, представляющих собой комплементарные тяжи, которые идентифицируются и локализуются на первичной структуре РНК. Таким путем удается выявить не только смежные (вдоль цепи) комплементарные участки, но и комплементарные взаимодействия между удаленными участками цепи РНК. Другой подход, особенно эффективный в выявлении дальних взаимодействий, состоит в фотоактивируемых сшивках оснований спаренных тяжей в составе структуры РНК с последующей идентификацией сшитых олигонуклеотидов.

Наконец, двуспиральные участки, предсказанные на основании комплементарности смежных или удаленных секций цепи, могут быть подтверждены или отвергнуты путем сравнительного анализа гомологичных РНК. Дело в том, что структуры РНК оказались эволю-ционно сильно консервативны. Изучение 16S РНК других бактерий и хлоропластов показало большую степень гомологии их первичных структур, наряду, конечно, с многочисленными нуклеотидными заменами. Если, несмотря на эти замены, в другой 16S РНК сохраняется комплементарность между теми же секциями и, соответственно, предсказанные спиральные участки занимают те же положения, то это сильно подтверждает реальность локализации данных спиралей. Совпадение в нескольких различных 16S РНК делает локализацию совсем убедительной.

Итак, совокупность вышеперечисленных экспериментальных и теоретических подходов дала возможность построить модель вторичной структуры 16S РНК Е. coli, представленную на рис. 42. Почти идентичные модели получены для 16S РНК других бактерий, х

страница 30
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136

Скачать книгу "Молекулярная биология. Структура рибосомы и биосинтез белка" (3.76Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
гирляды цветы для арки
канальное оборудование вентиляции это
цены монтаж акустическими панелями помещение
армирующие штукатурные сетки

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(19.01.2017)