химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

пей и п2 L-цепей* приводит к образованию п^щ различных центров связывания антигена. В обоих белках лигандсвязывающие центры расположены между доменом VL легкой цепи и доменом Ун тяжелой цепи (рис. 4.2, в). Таким образом, центр связывания образуют две различные полипептидные цепи. Использование двух цепей может быть решением проблемы образования практически неограниченного числа различных центров связывания, исходя из ограниченного объема генетического материала. Если число различных L- и Н-цепей равно соответственно /гх и /г2, то имеются % • п2 комбинаций VL - и Ун-Доменов, т. е. % • п2 различных центров связывания [540]. Величина пх • п2 была оценена в 107 [542], поэтому числа % и /гз должны иметь порядок Ш3— Ю4.

Существует шесть гипервариабельных сегментов, каждый из которых содержит от 5 до 10 остатков на центр связывания. Укладка цепей во всех вариабельных доменах иммуноглобулина New н иммуноглобулина МсРС 603, а также в других иммуноглобулинах очень сходна [540, 543 , 544]. Структурные различия сосредоточены в основном в так называемых гипервариабельных петлях [619] -— трех сегментах, содержащих от 5 до 10 остатков в обоих VL - и Уц-доменах. Аминокислотные остатки, образующие место связывания, комплементарное данному лиганду, принадлежат этим шести гипервариабельным сегментам.

Картина вставок и делеций, характеристичная для гипервариабельных областей, определяет размеры центра связывания. В случае Ig New место присоединения представляет собой неглубокий

о о

(~6 А) желоб с размерами 15 X 6 А. Центр связывания фосфор ило

холина в Ig МсРС 603 расположен на глубине 12 А.

Модель связывания в системе иммуноглобулин — лиганд

* Буквами Н и L обозначены соответственно тяжелая (heavy) и легкая Иммуноглобулины с известной структурой используются для исследования иммуноглобулинов, обладающих другой специфичностью. Область иммуноглобулинов VLIVH МОЖНО рассматривать как состоящую из жесткого остова, к которому присоединены гипервариабельные цепи. Это создает основу для сравнительного анализа систем иммуноглобулин — лиганд путем построения модели •с использованием координат остова (по областям известной структуры VL/Vh) и аминокислотных последовательностей гипервариабельных областей анализируемого иммуноглобулина. Первым белком, исследованным с помощью такого подхода Г291, 620], был белок IgA МОРС 315 миеломы мыши, который, как известно, присоединяет производные 2,4-динитрофенила. Полученные результаты были впоследствии уточнены Дьюком и сотр. [621], которые применили построение модели в сочетании с изучением ядерного магнитного резонанса, электронного парамагнитного резонанса и реакций химической модификации.

В принципе возможен систематический анализ любой системы иммуноглобулин — лиганд. Исследование моделей связывания может проводиться систематическим образом, поскольку у млекопитающих, например кроликов или коз, синтез антител может индуцироваться по отношению к любой специально подобранной молекуле (с низкой или высокой молекулярной массой). Используя аффинную хроматографию, получаемые антитела затем очищаются. Как правило, эта процедура приводит к вырожденному иммунному ответу, т. е. к синтезу нескольких видов антител несколькими клонами так называемых клеток плазмы [542]. Эти антитела отличаются константами сродства к лиганду, что проявляется также в химических, спектральных и иммунологических свойствах центров связывания. Последующие анализы аминокислотной последовательности показали, что различия вызваны аминокислотными заменами в гипервариабельных областях доменов VL И VH [622]. На первый взгляд кажется, что вырожденный ответ должен усложнить пространственную организацию центров связывания. В действительности, однако, в этом случае возможно объединить и взаимно контролировать данные по нескольким центрам связывания, что заметно увеличивает вероятность нахождения правильных моделей.

Системы иммуноглобулин — лиганд как модели прочих взаимодействий белок —лиганд

Наши представления о взаимодействиях белок — лиганд до сих пор настолько ограниченны, что для получения надежной информации в каждом конкретном случае необходим рентгеноструктурный анализ [623]. Такой подход не может распространяться на все белки, хотя бы потому что большинство наиболее интересных белков, например мембранные белки, не поддаются кристаллизации. Поэтому важно по имеющимся уже данным вывести некие общие правила связывания лигандов.

Наиболее удобны для этой цели комплексы иммуноглобулин ?— лиганд, поскольку, как отмечалось выше, для них был развит достаточно систематический подход к проблеме.

Комплексы иммуноглобулин — лиганд имеют сходство с комплексами фермент — лиганд. Существуют явные параллели между связывающими свойствами иммуноглобулинов и ферментов [85, 624,. 625]:

а) Как показывают значения констант скоростей

(до 108 М-1 • с-1), стадия связывания часто представляет собой

реакцию, контролируемую диффузией.

б) Связываемый лиганд имеет низкую вращательную свободу;

он прочно и специфи

страница 94
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
ремонт холодильников на дому в железнодорожном дешево
купить macbook в кредит
http://www.prokatmedia.ru/plazma.html
купить книжные полки на стену

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(21.09.2017)