химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

ехмерной структуры было установлено, что укладка цепи может сохраняться в высокой степени. Кроме того, стало очевидным, что белки, выполняющие различные функции, существующие в разных тканях и в разных организмах, могут иметь большое сходство и, следовательно, одинаковое происхождение. Эти факты явились важными стимулами к использованию структурного анализа белков, и в особенности анализа аминокислотной последовательности, для изучения эволюции на уровне макромолекул [145].

Морфологическое сходство глобинов и цитохромов Ъ

Гомология цитохромов, находящихся в различных цепях электронного переноса, может указывать на гомологию цепей переноса.

* Цитохромы классифицируют по их спектру поглощения в области длин волн между 400 и 600 нм. Эти спектры зависят от типа тема (цитохром Ь, например, содержит протогем IX) и от способа соединения гема с поли-пентидной цепью. Согласно этой номенклатуре, отнесение белков к цитохро-мам 6-типа, не означает, что они имеют общее с ними свертывание цепи [509. 561].

В настоящее время получены некоторые данные о том, что глобины родственно связаны с определенными цитохромами Ь-типа*; в этом отношении наиболее интересны цитохромы b2, Ь5 и b~a62- Данные об этих цитохромах приведены в табл. 9.6. Как было предсказано по спектрам протонного магнитного резонанса [556] и установлено сравнением аминокислотных последовательностей [557], цитохром Ь5-гсф (гем-связывающий фрагмент) и цитохром Ь^-гсф представляют собой гомологичные белки с различием последовательностей около 72% (185 РАМ). Подобие оказывается еще более разительным, если сопоставить последовательность Ь2-тсф с известной кристаллической структурой &5-гсф [297, 557]. Гомологические связи цитохромов Ь2-тсф и &5-гсф показывают, что не только эти два белка, но и все цепи,

Свойства цитохромов b2, Ьъ и Ьъ

Таблица 9.6

Цитохром Ь2 из митохондрий дрожжей [561], идентичный L-лактатдегидро-геназе (КФ 1.1.2.3) дрожжей

Цитохром ЬЛ из эндоплачматичеекого ретикулума (микросом) печени теленка [561]

Цитохром fcgg2 из Escherichia coii [561, 609]

функбелка

Белок в целом

Возможная ция всего

Гем-связывающий участок

Известные структурные свойства гем-св языв ающе-го участка

Растворимый тетрамерный белок; каждая субъединица (молекулярная масса 58 000) состоит из одного FMN-содержащего домена и одного гем-содержа-щего домена

Ь2 переносит электроны от L-лак-тата к цепи дыхания по следующему пути:

домен 6,

L-лактат -* Ь2 (FMN-содержа-щий домен) ->- гем-содержащнй

цитохром с

Ь2-гсф (ядро цитохрома 62), гем-связывающий фрагмент, получен специфическим протеолизом Ь%\ содержит 95 аминокислотных остатков

Аминокислотная последовательность Ь2-гсф [557] гомологична последовательности гем-связы-вающего фрагмента br0 [611, 612] и может быть сопоставлена с известной третичной структурой й5-гсф

Связанный с мембраной мономерный белок (молекулярная масса 16 700). способный к агрегированию in vivo. 40 из 50 C-концевых остатков находятся в мембране

Ь5 переносит электроны от NADH к некоторым функциональным звеньям метаболизма (например, к «десатуразе жирных кислот» [610]); путь электрона: NADH -* FAD-содержащий белок -I- гем-содержащий домен Ьъ > «цианид-чувствительный фактор»

Ь5-гсф, гем-связывающий фрагмент, получен специфическим протеолизом Ьъ; содержит 93 аминокислотных остатка

Аминокислотная последовательность й5-гсф[6П, 612] гомологична последовательности гем-связыва-ющего фрагмента Ьг [557]. Третичная структура &5-гсф известна [297]

Мономерный белок (молекулярная масса 12 000) из растворимой фракции экстрактов Е. coll

Неизвестна

Гемопротеид содержит ПО аминокислотных остатков

Аминокислотная последовательность Ь5в2 [613] может быть гомологична последовательности миоглобнна кита [554]. Начат анализ третичной структуры й6в2 [563]

осуществляющие электронный транспорт (табл. 9.6), могут происходить от одного предшественника.

Структурное подобие цитохромов &-типа и глобинов. Аминокислотная последовательность цитохрома 6562 отличается от последовательностей 62-гсф и 65-гсф, но, по-видимому, гомологична последовательности миоглобина [558]. Эти данные, а также результаты некоторых других исследований [559], показавших возможность существования непрерывного набора гомологичных структур в интервале от цитохромов Ь-типа до глобинов, дали толчок к сравнительным исследованиям [406, 560] известных* пространственных структур 65-гсф и |3-цепи гемоглобина. Это сопоставление показало [560], что из 85 остатков цитохрома Ь5-гсф, пространственное расположение которых известно, 51 остаток имеет свой аналог в глобине. При совмещении обеих структур атомы железа тема оказываются

о

на расстоянии, меньшем 1,4 А, а угол между нормалями составляет около 10°. Это отвечает величинам, найденным при сравнении эритро-круорина (гемоглобин насекомого) с миоглобином [277] и при сравнении восстановленного цитохрома с с окисленным цитохромом с [273, 564]. Железо координирующий гистидин и две соседние спирали гемоглобина соответствую

страница 84
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
программа корол обучение
кресло т501
выравнивание вмятин без покраски в подольске
нож для разделки рыбы

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(05.12.2016)