химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

тельно, эта замена не означает перехода СВ—ОТ матрицы аминокислотных различий, д — система из шести линейных уравнений, отвечающая топологии, данной в г. pv означает число крестиков в ветви СВ—a, conn — число крестиков в ветви а—(5 н т. д. Система имеет решение, если первое уравнение приравнено 3, а не 2, т. е. если рассматривать аминокислотную замену в том же положении. При другой топологии решения нет. е — филогенетическое древо, построенное по топологии рис. г.

Трипеиноподобные сериновые протеазы [138, 536] образуют семейство расщепляющих белки ферментов, которые контролируют многие важнейшие физиологические процессы (табл. 9.4).Пищеварительный фермент трипсин, для которого и был впервые употреблен термин «энзим» (фермент), является наиболее изученным членом этого семейства. Он известен уже более ста лет, а его способность к расщеплению пептидных связей вблизи лизиновых и аргининовых остатков очень сходна со свойствами большей части других белков из этого семейства. Однако большинство родственных трипсину ферментов намного более специфичны, чем сам трипсин: каждый из них. расщепляет в белке только одну или очень небольшое число пептид* ных связей. Структурная гомология сериновых протеаз была изучена и обобщена Хартли в 1970 г. [490]. Попарныесравнения трипсина,, эластазы, химотрипсина и тромбина показывают, что около 40% их аминокислотных последовательностей идентичны (58 РАМ).. На сегодняшний день известны структуры первых трех из этих ферментов. Как и предсказывалось, все они имеют одинаковую укладку цепи [18, 243—245].

Таблица 9.4

Сериновые протеазы, участвующие в процессах, поддерживающих жизнедеятельность, и в процессах, угрожающих жизни человека

Протеаза

Местонахождение в активном состоянии

Управляемый (пато)физиологический процесс

Трипсин Тромбин

Плаз мин

Акросомальная протеаза спермы

Компоненты системы комплемента

Калликреин

Протеаза оболочки клетки

JU-протеаза Д-нротеаза

Тонкий кишечник

а) Кровь

б) Воспаленные ткани

Раны и воспаленные тканн

Яйцеклетка

Цитоплазматические мембраны бактерий, зараженные ткани

Кровь и ткани

Воспаленные ткани

Клетки саркомы Клетки миокарда и другие клетки

Переваривание белка Свертывание кровн Отторжение ткани Растворение временных

сгустков фибрина Оп ло до тв о ре н ие

Разрушение чужеродных клеток, инициация процессов воспаления и т. д.

Регуляция кровообращения и ощущение боли

Разрушение патогенных и эластичных соединительных тканей

Рост опухоли

Освобождение смертоносного дифтерийного фермента от токсина

Последовательности протеазы В и химотрипсина можно сопоставить на основании их трехмерной структуры. Трипсиноподобные ферменты были обнаружены также в микроорганизмах. Streptomy-ces griseus, например, содержит так называемую проте(ин)азу В, которая включает только 186 остатков (по сравнению с 234 в химо-трппсине). Данные рентгеноструктурного анализа показывают, что укладка цепи протеазы В очень сходна с укладкой цепи химотрипсина [2461. Как можно заключить из трехмерных структур, делеций и вставки происходят только на поверхности молекулы. Это видно из рис. 9.4. Ранее уже говорилось о том, что сохранение внутренней части белка можно рассматривать как общее правило. В результате сопоставления аминокислотных последовательностей на основе геометрических данных выяснилось, что идентичны только 13% остатков, что отвечает генетическому расстоянию между химотрипсином и протеазой В в 432 РАМ. При таком расстоянии невозможно уста-цовить гомологичность белков только по их аминокислотным последовательностям (разд. 9.6 и работа [803]).

Расположение остатков в каталитическом центре, своеобразном химическом ноже для расчленения пептидных связей, очень хорошо сохранилось во всех сериновых протеазах, тогда как специфичность

Полипептидные цепи а-химотрипсина и протеазы В из Sireptomyces griseus [18]. Цепь химотрипсина показана в виде ленты, прогнутой при каждом атоме С7, Первый-Р-структурный цилиндр (рис. 5.17, г) находится в верхней левой части рисунка, а второй — в правой нижней части. Цепь протеазы В свернута так же. Но в ней отсутствуют те части ленты, которые зачернены. Кроме того, имеются вставки в местах, отмеченных на ленте кружками. Отметим, что все вставки и делеции расположены иа поверхности

молекулы.

к субстрату претерпела значительные изменения. Этот факт может означать, что каталитический механизм достиг физико-химического оптимума [537, 538]. Однако существуют и другие возможности для расщепления пептидных связей; в различных семействах протеиназ [145, 539] действуют разные каталитические механизмы.

Иммуноглобулины, антигены трансплантации и пероксид-дисмутаза

Характерный участок свернутой цепи приблизительно из 100 остатков, присутствующий в совершенно различных белках, был назван «Ig-свертыванием» [540—543], поскольку впервые его обнаружили в иммуноглобулине [75, 292, 544, 545]. Ig-свертывание используется в качестве конструкционного элемента только в иммуноглобулинах, в цитозолиевой п

страница 82
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
аренда дома в жуковке
авторамка для номера
ксн-11с купить
ремонт холодильника Liebherr SBS 7253

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(23.03.2017)