химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

была учтена возможность связывания в двух местах иона Са2+. Поскольку эти центры расположены в коротких петлях между спиралями [59], можно предполагать, что они влияют на относительную ориентацию соседних спиралей, а значит, и на процесс свертывания.

Заключение

В настоящее время многие принципы и детали процесса свертывания поли пептидной цепи остаются непонятыми. Мы знаем, что этот процесс происходит самопроизвольно и что, следовательно, он основан на простых физико-химических принципах. Это позволяет надеяться, что свертывание удастся объяснить и промодели

ровать с помощью теоретических подходов. Сейчас уже сделаны первые попытки в этом направлении. Интерес к процессу свертывания объясняется не простым научным любопытством, а имеет значительно более глубокие причины. Чтобы проникнуть в сущность биологических процессов, мы должны знать трехмерную структуру различных белков, в том числе и тех, которые невозможно закристаллизовать, а значит, сделать доступными для рентгеноструктурного анализа. Единственная надежда на раскрытие таких структур связана с возможностью их определения по аминокислотным последовательностям. Такое установление должно следовать по пути процесса естественного свертывания: отбор всех возможных конечных структур данной полипептидной цепи по их свободной энергии столь же безнадежен, как и попытка ответить на вопрос, отвечает ли натив-ная структура локальному или глобальному минимумам энергии.

Наиболее сложной проблемой динамики свертывания является описание промежуточных состояний. Единственные сведения о структуре этих состояний пока могут быть получены только по образующимся в них дисульфидным связям. К сожалению, вполне возможно, что процесс свертывания белков, содержащих связь S—S, качественно отличается от свертывания других белков, и таким образом, мы получаем здесь только ограниченную информацию.

Большие усилия направляются на поиск нуклеации —? зародышей процесса свертывания, которые, как предполагают, служат основой дальнейшего свертывания. Такие зародышевые образования должны иметь исключительно стабильную структуру. Возможно, что их можно будет обнаружить с помощью антител или экспериментов с повторным свертыванием модифицированных белков. Локализация зародышей должна в большой мере облегчить моделирование свертывания. В любом случае очевидно, что понадобится еще очень большое число экспериментов, прежде чем загадка процесса свертывания будет разрешена.

Глава 9

Эволюция белков

Биология — естественная наука, имеющая исторические корни.

Все существующие биологические виды постепенно развились из - - одного или из очень ограниченного числа предшественников. Поскольку в событиях прошлого важную роль мог играть случай, мы должны смириться с тем обстоятельством, что направления эволюции, по-видимому, никогда не удастся полностью объяснить в терминах «причины» и «следствия». Исследователям, склонным к построе-7: нию стройных систем на основе развития неких общих принципов, это представляется серьезнейшим препятствием. Однако квазислучайное развитие привело к огромному разнообразию биологических видов, которое можно рассматривать как результат многочисленных экспериментов природы. Мы должны быть признательны за эти эксперименты, и должны анализировать и интерпретировать их результаты.

* Применяя термин «история» мы обычно имеем в виду каким-то образом зарегистрированные события. В этом смысле использование этих понятий для белков означает, что мы рассматриваем нуклеотидную и аминокислотную последовательности как запись событий прошлого.

** Следует учитывать, что нам известна структура только существующих в настоящее время белков. Поэтому мы можем судить об эволюционных изменениях в прошлом лишь по имеющимся различиям между гомологичными белками.

В процессе эволюции белков происходят замены отдельных остатков, вставки и делеции нескольких остатков, удвоение и слияние генов. Для белков основные этапы исторического* процесса знаменуются заменами аминокислотных остатков в полипептидной цепи. С течением времени эти замены накапливаются, так что в конечном счете какое-либо сходство между исходной** и окончательной аминокислотными последовательностями может исчезнуть. Однако, как правило, даже после того как исчезнет сходство аминокислотных последовательностей двух гомологичных белков, сохраняется соответствие в укладке их цепей. Тенденции к замещениям заметно отличаются у остатков в разных положениях в цепи (рис. 7.1, б). Различия гомологичных белков не исчерпываются за

мещениями отдельных аминокислот. Более значительными событиями являются вставки и утраты (пропуски, делении) отдельных остатков или целых групп остатков (рис. 7.1, а). Наличие таких вставок и делеций значительно затрудняет сопоставление последовательностей отдаленно родственных белков [803].

Существенную помощь в подобных случаях оказывает знание трехмерной структуры белков. Имеющиеся в настоящее время данные показывают, что обычно остатки, находящиеся во внутренней части белка, мало подвержены из

страница 73
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
взять в аренду проэктор
Компания Ренессанс: лестницы в леруа - качественно и быстро!
стул самба купить
аренда контейнера для хранения

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(10.12.2016)