химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

дельных нуклео-тидов в полинуклеотидной последовательности, настолько нарушают порядок нуклеотидных триплетов, что правильное определение аминокислот оказывается пока не возможным.

Это наглядно иллюстрируется одной из последних работ [11] по белку оболочки вируса табачной мозаики, где определялась последовательность во фрагменте РНК; эта нуклеотидная последовательность была переведена в аминокислотную, которую в свою очередь можно сравнить с экспериментально найденными аминокислотами. Как видно из рис. 1.6, эти два полипептида никоим образом не идентичны ни по аминокислотной последовательности, ни по составу аминокислот.

Возможность определения последовательности полипептида по последовательности коллинеарной нуклеиновой кислоты представляет не только чисто теоретический интерес. Дело в том, что в настоящее время особенно велик прогресс как в накоплении генетического материала, так и в расшифровке последовательности нуклеиновых кислот; в то же время многие важные белки удается получить пока еще лишь в ничтожных количествах. Полный анализ последовательности полинуклеотида, сопровождающийся исследованиями фрагментов последовательности коллинеарной полипептидной цепи для гарантии правильности фаз трансляции, может стать полезным методом определения первичной структуры белков [12].

Некоторые сегменты ДНК кодируют более чем один белок. Коллинеарность аминокислотных и нуклеотидных поледовательностей

На5лю§аемая 95 ,(» 1« 110

аминокислотная Glu —V«l—Glu— А»л—Gin—All—An—Pro—Tbr—ТЫ—All— Glu—Thr— L«j— Ач>—All—Thr—Arj -AT— Vil-A*

последователь лость Аминокислотная ггоследавательность^выведенная из последобательности РНК

Glu—Vil—G1o— Am—Gin—All— A»n—Pro—Arg—Liu—Pro— Lyt— Arj— End—Met—Liu—l«u— V»l—Gtu—End—Thr

Последователь насть РНК (со- gaa-guu-gaa-aau-caG-gcg-aac-cca-cga-cug-ccg-aaa-cgu-uag-aus-cua-cuc-gua-gaghjag-ac©

держит ошиб- i

*y) ]

Недостаю щ а и

Рис. 1.6.

Установление аминокислотной последовательности по соответствующей ну-клеотидной последовательности. В первой строке показан сегмент аминокислотной последовательности белка оболочки вируса табачной мозаики» а в третьей—-соответствующая последовательность РНК [11].

Одна ошибка в последовательности ведет к неправильной аминокислотной последовательности {см. вторую строку), начиная от остатка 103. Ошибка, по-внднмому, заключается в отсутствие С в отмеченном положении, так как при наличии С большая часть последующих аминокислот приобретает правильный порядок. Такие ошнбкн, связанные со «сдвигом рамки» часто обнаруживаются по появлению в неожиданном положении

кодонов End (вторая строка).

привлекла особое внимание после сообщения о полной первичной структуре РНК, выделенной из вируса MS2 [13], и о ДНК, выделенной из вируса 0X174 [12]. Бактериальные вирусы MS2 и 0X174 — первые «живые» частицы, для которых была выяснена полная химическая структура генетического материала.

ДНК 0X174 длиной в 5375 нуклеотидов содержит перекрывающуюся генную систему [14]: два белка считываются с одной и той же последовательности ДНК, но в различных фазах (рис. 1.7). Это означает, что общее число аминокислотных остатков в последовательности белка может быть больше, чем только одна треть

8 8 8

ДНК

Белки ? и J

белок Х>

3 4 5

3 0 0

. . . GCGGAAGGAGTGATGTAATGTCT. . .

. . . -Arg-Lys-Glu End Met-Ser-. . .

. • .-Ato.-Glu-Gly-Vo.bMet End

Рис. 1.7.

Перекрывание нуклеотидных последовательностей различных генов [12]Показан сегмент 833—855 генома бактериофага начало кодока белка / в положении 850.

от числа кодирующих ее нуклеотидов. Вопрос, наблюдается ли перекрывание генов в других прокариотных или эукариотных организмах, остается пока открытым.

1.4 Свойства боковых цепей

Канонические аминокислоты отличаются только боковыми целями. Каждая боковая цепь настолько специфична, что ее нелегко заменить какой-либо другой. Ниже будут рассмотрены свойства всех стандартных боковых цепей.

Gly увеличивает подвижность основной цепи. Это уникальная аминокислота, которая лишена боковой цепи и поэтому не проявляет асимметрии при Са-атоме. Отсутствие боковой цепи позволяет остаткам Gly принимать необычные двугранные углы (рис. 2.3, л), что приводит к изгибам основной цепи. Кроме того, остатки Gly могут способствовать образованию плотной упаковки цепи «белковой молекулы. Вероятно, по этим причинам остаток Gly практически не замещался в процессе эволюции.

В боковой цепи аланина находится одна метильная группа. Это небольшой неполярный остаток, не имеющий какой-либо особой предрасположенности находиться внутри или на поверхности белка. Ala — самая распространенная аминокислота, по-в

страница 6
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
999RMV37BL
купить билеты на концерт москва онлайн
Прихожие С полкой
КНС - Кликните и при заказе введите промокод "Галактика" на скидку - 90NB0D38-M00090 - супермаркет компьютерной техники.

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(08.12.2016)