химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

ецифичные домены, необходимые для обеспечения заданной функции, отбираются и объединяются в одной цепи глобулярного белка [124, 256].

5.5 Агрегаты глобулярных белков

Не существует принципиальных различий между агрегированием структурных доменов и агрегированием глобулярных белков.

Различия между ассоциацией структурных доменов одной цепи и ассоциацией глобулярных белков, т. е. разных цепей, весьма расплывчаты. Так, в роданезе (рис. 5.17, а) домены одной цепи при агрегировании образуют систему с высокой симметрией [257], как и субъединицы димерного белка. При образовании оболочек вируса полиомиелита [163] и вируса лесов семлики [258] большое число белковых глобул формируется из одной полипептидной цепи, а затем уже разделяется протеазой. После расщепления белок симметрично агрегируется с образованием оболочки вируса. Это показывает, что отдельные домены мультидоменного глобулярного белка могут быть стабильны сами по себе, а также могут выполнять роль независимых глобулярных белков. Однако в общем случае субъединицы крупных белковых агрегатов синтезируются и свертываются раздельно.

Причин агрегирования довольно много. Среди многообразных функций, выполнению которых способствует агрегирование, можно упомянуть следующие: (1) создание сложного полифункционального механизма; (2) сближение ферментов одного метаболического пути в целях исключения потерь метаболических промежуточных продуктов; (3) построение структур заданной геометрии, например длинных каналов; (4) снижение осмотического давления или (5) увеличение числа возможных проявлений ферментативной активности, а значит и новых типов регуляции.

Симметрия агрегатов

Асимметричные агрегаты выполняют сложные функции. Все

агрегаты могут быть подразделены на асимметричные и симметричные. Типичным асимметричным агрегатом (который входит также и в РНК) является рибосома. Функции рибосом в синтезе белка настолько сложны, что для их выполнения необходима большая группа различных белков, а неидентичные белки могут агрегироваться только асимметрично.

Агрегаты могут иметь пространственную или линейную симметрию, а также симметрию точечной группы. Симметричные агрегаты можно разделить на агрегаты, обладающие пространственной или линейной симметрией, а также симметрией точечной группы. Симметрия пространственной группы обнаружена в кристаллах инсулина, которые образуются в поджелудочной железе и обеспечивают форму, которая может сохраняться при пренебрежимо малом осмотическом давлении [259]. Симметрия такого же типа наблюдается в поперечнополосатых мышцах позвоночных и насекомых [215]. Линейные группы были найдены в микрокапиллярах [181], вирусе табачной мозаики [180] и нитевидных фагах [220]. Симметрия точечной группы очень распространена. Симметрия аминокислот исключает точечные группы, содержащие центры инверсии или отражения, так что возможны лишь группы, п, п2, 23, 432, 532 при п = 1, 2, 3 ... [252, 260]. Примеры всех этих групп, за исключением 23, приведены в табл. 5.4.

Как уже обсуждалось в предыдущих разделах, симметричные образования энергетически предпочтительны. По-видимому, только в случае гексокиназы наблюдается асимметричная агрегация идентичных единиц, и то лишь в кристаллическом состоянии [261]. В некоторых случаях может реализоваться «псевдосимметричное» расположение. Обычный гемоглобин человека, например г имеет идеальную симметрию 2 и псевдосимметрию 222. Псевдо

симметрия оказалась бы точной в случае идентичности (3- и гх-субъединиц. Если все субъединицы химически идентичны, но имеют две несколько различающиеся конформаций, т. е. образующие довольно близкие контакты, то появляется так называемая квазисимметрия. Она часто встречается в сферических вирусах. При наличии квазисимметрии белок одного типа может образовать икосаэдр ическую оболочку [262], которая приближенно аппроксимируется сферой. В вирусе кустистого карликового томата субъединица содержит два структурных домена. Информационное различие вызвано относительной подвижностью этих доменов [263].

Контакты между субъединицами в дегидрогеиазах

В 222-тетрамере необходимо образование только двух типов контактов из трех возможных. Рассмотрим типы контактов, которые могут возникать в симметричном олигомере, на примере четырех дегидрогеназ с известной структурой. s-Малат- и алкоголь-дегидрогеназы представляют собой димеры идентичных субъединиц с точечной группой 2, а лактат- и глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназы — тетрамеры идентичных субъединиц с точечной группой 222 (рис. 5.16, а). Димеры образуют контакт только одного типа вблизи поворотной оси 2-го порядка (рис. 5.1§, а). В тет-рамерах имеются три типа контактов, по одному на пересечении с каждой осью второго порядка (рис. 5.18, б). Отметим, что для стабилизации тетрамера необходимы только два из трех контактов.

Контакты 222-тетрамера можно представить тригональной диаграммой. Контакты тетрамера можно условно описать тетраэдR R

Рис. 5.18.

Олигомерные ферменты — дегндрогеназы.

а — схема симметричного димера, например

страница 42
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
как называется шашка такси
немецкие ножи хенкель
боковины (опоры) для скамеек
кц москвич мероприятия официаьный сайт февраль 2017 г

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(25.03.2017)