химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

>ческой поверхности выступы с шагом 9 А.

Коллаген — наиболее распространенный белок млекопитающих.

Коллаген, состоящий из сильно вытянутых полипептидных цепей, может выдерживать значительное механическое напряжение вдоль оси, поскольку оно по направлению совпадает с ориентацией ковалентных связей его пептидного остова. Поэтому структура коллагена хорошо соответствует характеру выполняемых им функций — передавать усилия в сухожилиях, образовывать защитный слой кожи и других органов. Коллаген безусловно является одним из самых распространенных в природе белков.

Тройные спирали коллагена большинства позвоночных состоят из двух агцепей и гомологичной а2-цепи. Пока известна аминокислотная последовательность только осгцепи, которая включает 1052 остатка [195—1971. За исключением 16 N-концевых и 25 С-концевых остатков, состав (GIy-X-K)m в ней строго соблюдается. Пользуясь этой формулой, можно легко выявить в различных аминокислотных последовательностях коллагеноподобные структуры. В глобулярных белках такие структуры пока еще не были обнаружены. Однако весьма вероятно, что они присутствуют в компоненте Clq системы комплемента человека [1981, которая узнает антитела, соединенные с антигенами. Как установлено по электронным микропрограммам, это белок содержит пучок из 18 параллельных цепей, организованных в шесть коллагеноподобных волокон, которые входят в шесть глобул. Возможно, что в дальнейшем будут выявлены и другие смешанные белки, содержащие коллагеноподобные структуры.

'Реверсивные повороты пептидной цепи

Пептидная цепь может образовывать резкие повороты, включающие водородную связь. При исследовании предпочтительных конформаций трех последовательно расположенных пептидных звеньев (от С* до С4+3) Венкатачалам [1991 обнаружил три структуры с водородной связью между атомами Ot и Ni+3. Они были названы реверсивными поворотами пени I, II и III. Поворот III представляет собой участок описанной выше спирали 310 (рис. 5.4). 'Поворот I —- это деформированная спираль 310, в которой углы ?(0, if) правильной спирали приобретают несколько различные

?значения для Ci+I и Са+2 (рис. 5.7, а). У поворота II плоскость пептидной группы между остатками в положениях i -f 1 и i -f- 2 резко меняет свою ориентацию (рис. 5.7, б) и углы (0, ty) при атомах и С[+2 приобретают существенно отличные значения (рис. 5.7, а). Это ведет к серьезным стерическим затруднениям между атомом <Ог+1 и боковой цепью остатка /4-2; напряжения в цепи в случае

Рис 5.6.

Реверсивные повороты цепи.

а — области двугранных углов основной цепн остатков t+l (пунктирная линия) н ?+-2 (сплошная лнння) в реверсивных поворотах типа I, II и III [199]. Соответствующие об-пасти соединены стрелками. В случае поворота III обе области совпадают между собой и с положением Зю-спирали (рис. 5.4). б— повороты типов 1 н II [326]. В типе II имеются стерические затруднения между боковой цепью #,-+2 н О/ц-р так что в положении остатка 1+2 должен находиться Gly. Поворот типа III см. на рис. 5.4,

поворота II не возникают, если в положении i 4-2 находится остаток Gly. Зеркальные отображения реверсивных поворотов I, II и III, называемые поворотами Г, IIи IIГ, невыгодны по стериче-ским причинам.

Реверсивные повороты цепи часто встречаются в белках. Анализ поворотов цепей в глобулярных белках показал, что они очень распространены и в их образовании участвует около одной четверти всех остатков Г200, 201J. Далее, было выяснено, что повороты I, II и III составляют соответственно 35, 15 и 15% от их общего числа [202]. Как и следовало предполагать, почти все найденные повороты II содержат в положении i 4-2 остаток Gly. Общая распространенность зеркальных отображений (повороты Г, II' и IIГ), как и ожидалось, низка и составляет 10%. Нестандартные реверсивные повороты, не содержащие водородных связей, встречаются с частотой 25%. Они идентифицируются с помощью более общего критерия,

согласно которому расстояние между атомами С? и Са+3 должно

о

быть меньше 7 А при иной, чем а-спираль, конформаций основной цепи. Такой критерий включает все стандартные повороты цепи, однако допускает возможность и других реверсивных конформаций. Иногда нестандартные повороты содержат цис-Рто; в частности Рго-93 и Рго-114 в рибонуклеазе [39], Рго-168 в субтилизи-не [40] и Рго-116 в нуклеазе стафилококка [41].

Большинство поворотов находится на поверхности белка. Анализируя расположение поворотов в белках, Кунтц [203] обнаружил, что они сконцентрированы на поверхности. В соответствии с таким расположением они содержат в основном гидрофильные остатки. Предполагается, что в процессе свертывания повороты играют только пассивную роль, образуя участки наименьшего сопротивления невалентным силам, стремящимся изогнуть цепь. Это! предположение подтверждается большим разнообразием наблюдаемых поворотов, ни один из которых не имеет особенно стабильной конформаций.

fi-Складчатый лист

Вытянутые полипептидные цепи могут взаимодействовать между собой посредством водородных связей и образовывать сл

страница 33
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
стоимость аренды ноутбука
Фирма Ренессанс лестницы в новосибирске - продажа, доставка, монтаж.
престиж самба кресло
москва склад вещей

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(10.12.2016)