химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

осахариды с боковыми цепями или без них [178], а также в

РНК (ДНК), где рибозафосфатдиэфирные элементы обычно образуют в результате переплетения двух антипараллельных отдельных спиралей двойную спираль [179]. Вирус табачной мозаики состоит из белковой оболочки и РНК. Оболочка представляет собой линейную группу, элементом которой служит один белок, присоединенный к тринуклеотиду [180]. Цилиндрические конструкции из белков, найденные, например, в микротубулах [181], в хвостах фага Т4 [182] или в филаментах F-актина [183], часто описывают как спирали или линейные группы. Тем не менее следует помнить, что подобные агрегаты не содержат линейных цепей, таких, как, например, РНК, которая соединяет белковые субъединицы в вирусе табачной мозаики и образует особую спираль. Для описания таких моно- и полиспиральных образований используются различные способы.

3io-, а- и я-Спирали

Правильные спирали полностью описываются парой двугранных углов. Строение этих спиралей показано на рис. 5.4, а их параметры приведены в табл. 5.1. 310-, а- и л-Спирали стабилизированы водородными связями между пептидными амидной и карбо

нильной группами остатков (i, i -j- 3), (/, i -j- 4) и (i, i -j- 5) соответственно. Следовательно, имеется возможность образовывать спирали с системами последовательных водородных связей между близкоотстоящими элементами цепи. Являясь линейными группами, спирали полностью описываются одной точкой на карте-0ф (рис. 2.3). Эти точки отвечают локальным энергетическим минимумам; возможны небольшие отклонения от этих минимумов.

а-Спираль очень стабильна и потому встречается наиболее часто. а-Спираль — наиболее часто встречающаяся в белках вторичная структура, в связи с чем ее конформация должна быть весьма стабильной. С этим согласуется расположение а-спирали в центре-разрешенной области на карте 0ф (рис. 2.3), а также тот факт, что диполи ее водородных связей имеют линейное расположение, также отвечающее минимуму энергии (разд. 3.4). Кроме того, радиус спирали (табл. 5.1) благоприятствует дисперсионному притяжению между остатками, расположенными по разные стороны от оси спирали.

а-Спираль была впервые постулирована Полингом и сотр. [251. В то время идея о спирали с нецелочисленным значением п была встречена скептически, поскольку она не согласовывалась с предположением о высокой степени упорядоченности молекул. Непосредственное подтверждение постулата было получено из данных рентгеноструктурного анализа кристаллического гемоглобина [183]. Позднее а-спирали были обнаружены во многих волокнах [184], в частности в а-кера-тине и парамиозине и почти во всех глобулярных белках. В самом деле, обозначения а и р для а-спирали и ^-структуры появились в связи с тем, что все рентгенограммы волокон подразделяли на а- и (З-рентгено-граммы, которые получали в -основном от образцов «-кератина и р-фиброина шелка.

На рис. 5.5 показано распределение наблюдаемых длин •а-спиралей в глобулярных белках. Средняя длина составляет

о

около 17 А, что отвечает 11 остаткам на 3 витка спирали. Значительный разброс в распределении показывает, что предпочтительных длин не существует, 'что согласуется с ожидаемыми свойствами линейной группы. 'Относительные максимумы для длин из 7, 11 и 15 остатков, отвечающие 2, 3 и 4 полным виткам, меньше ожидаемой ошибки распределения Пуассона (ж 25]/2= 5), в связи с чем их значимость довольно сомнительна. а-Спирали обеспечивают белковые структуры довольно прочными «стержнями». Изгибы этих стержней на углы около 20° часто осуществляются путем включения остатков Pro, как это можно видеть в миоглобине [185] и аденилаткина-зе [186].

Зш-Спирали встречаются редко и образуют только очень короткие участки. 3-10Спираль получила название по числу остатков на виток п = 3 и по числу атомов (10) в цикле, образованном водородной связью [187]. Диполи, образующие водородные связи.

не находятся на одной линии, что не отвечает минимуму энергий (разд. 3.4). Упаковка боковых цепей в этом случае также довольно-невыгодна. Как видно из рис. 5.4, боковые цепи имеют одинаковое азимутальное положение, тогда как в сс-спирали они находятся в скрещенном положении. На карте (0, ур) (рис. 5.7) 310-спираль попадает на край разрешенной области, что свидетельствует о наличии небольших стерических трудностей. Энергетически невыгодное пространственное строение объясняет малую распространенность 310-спиралей в белках; обычно ее участки образуют примерно-один виток (в гемоглобине морской миноги имеются две 310-спирали^ каждая длиной по два витка [188, 189]). Эти участки обычно находятся при N- и С-концах сс-спиралей.гг-Спираль невыгодна. ^-Спираль ни разу не удалось наблюдать на опыте, так что она представляет пока чисто академический интерес. Эта спираль находится на краю разрешенной области (рис. 2.3), что указывает на наличие в ней стерических трудностей [29, 190]. Диполи, образующие водородные связи, выстроены благоприятно. Вследствие большого радиуса г (табл. 5.1), атомы основной цепи, находящиеся по разные стороны от оси

страница 31
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
учебный центр по вентиляции краснодар
шашки taxi
такси трезвый водитель
проволока вязальная 1 2 цена за тонну

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(26.05.2017)