химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

руктура белков 59*

4.1 Ансамбли цепей 59

Функциональные и структурные домены 59*

Влияние окружения 61

Три основных физиологических вида белковых молекул 63

Иммуноглобулины и белки HL-A 64

Олигомерные белки 65

4.2 Дисульфидные связи 66

Роль мостиков S—S во внеклеточных и внутриклеточных

белках 68

Дисульфидные мостнкн как составные части структуры

белков 69

4.3 Модификации главной цепи, контролируемые ферментами 71

N- и С-концы 71

Специфическое расщепление полипептидной цепи .... 72

Активация трипсииогена 74

Действие комплемента — результат защитной системы

пробелков 75

Сигнальные последовательности в пробелках ... 77

Расщепление белка 77

4.4 Контролируемые ферментами модификации боковых цепей 78

Поперечные связи на основе модифицированных остатков

Lys 78

Другие разновидности реакций модификации 80

Заключение 80

Глава 5 Способы свертывания и ассоциации полипептидных цепей 82

5.1 Вторичная структура 83

Линейные группы 83

310-, а- и я-Спирали 85

Спираль коллагена 88

Реверсивные повороты пептидной цепи 91

Р-Складчатый лист 93

5.2 Сверхвторичные структуры 97

Суперспирализация а-спиралей 97

р?3-Структурное образование 100

(З-Зигзаги и другие особенности 3-структур 102

5.3 Структурные домены 103

Корреляция между близко расположенным в последовательности остатками 103

Структурные классы 107

Симметрия 111

5.4 Глобулярные белки 116

5.5. Агрегаты глобулярных белков 117

Симметрия агрегатов . 118

Контакты между субъединицами в дегидрогеназах ... 120

Поверхности контакта 121

Свободная энергия ассоциации 123

Специфичность взаимодействия белок — белок .... 125

5.6 Иерархия уровней 126

Заключение 127

Глава 6 Предсказание вторичной структуры по аминокислотной последовательности 129

6.1 Вероятностные методы 131

Склонность остатка встраиваться во вторичную структуру 131

Склонность двух остатков одновременно встраиваться во

вторичную структуру 133

Склонность трех остатков встраиваться во вторичную

структуру 135

6.2 Физико-химические методы I3&

Методы, основанные иа статистической механике ... 136

Методы, осиоваииые иа стереохимических даииых . . . 141

6.3 Применение предсказательных методов 143

6.4 Оценка предсказательных методов 145Произвольиость выбора параметров 145

Критерии оценки методов 14&

6.5 Замечания общего характера 153

Качество предсказания и локальные взаимодействия 153

Успех предсказания и центры свертывания 154

Предсказание как аналитический метод 155

Заключение 155

Глава 7 Модели, изображение и документация белковых структур 157

7.1 Даииые о строении белка 15Т

Ковалеитиое строение 157

Простраиствеииое строение 159Полные структуры 160

7.2 Представление полной структуры , . 161

Пространственные модели 16J

Двумерные представления [68

7.3 Абстрактные представления о свертывании цепи . .д". . . 172

Графики для углов основной цепи . 172

Карты расстояний между Са -атомами [74

Заключение 175

Глава 8 Термодинамика и кинетика свертывания полипептидной цепи 177

8.1 Термодинамические аспекты 177

Переход между двумя термодинамическими состояниями

цепи 177

Баланс энергетических вкладов в глобулярном белке 1795

Тепловые флуктуации в белковых структурах .... !80

Нативиое состояние: глобальный или локальный энергетические минимумы? 181

8.2 Быстрота, безошибочность и ограничения свертывания in

vitro 182'

8.3 Структурные элементы в иесвериутых цепях 184

8.4 Пути свертывания 18&

8.5 Влияние лигаидов 190

8.6 Моделирование процесса свертывания [92

Заключение 195

Глава 9 Эволюция белков . . 197

9.1 Специализация белков . I99>

Частота допустимых мутаций ? . \9§

Критерии фиксации аминокислотных замен в белках 201

Вероятность мутаций аминокислотных остатков .... 204

Влияние замен аминокислот на динамику свертывания 206

Замены аминокислот как эксперименты, проведенные природой 207

9.2 Филогенез иа основе структур белков 207

Белки, удобные для филогенетических исследований • - 208

Филогенетическое дерево 209Эволюция поведения н морфологии в сравнении с эволюцией белка 210

9.3 Дифференциация белков 211

Построение филогенетического дерева для вазотоцина,

окситоцина и вазопрессина 212

а-Лактальбумин и лизоцим 215

Трипсиноподобные сериновые протеазы . 216

Иммуноглобулины, антигены трансплантации и пероксид-диемутаза 219

«Свертывание типа глобинов» 219

Морфологическое сходство глобинов и цитохромов b . . . 222

Цитохромы типа с 225

9.4 Слияние генов , 227

Процесс слияния генов 227

Слияние генов и эволюция .' '228

Мультипликация генов 229

9.5 Конвергентная эволюция белков 232

9.6

страница 149
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
проектор прокат москва
Фирма Ренессанс лестница винтовая купить - цена ниже, качество выше!
стул изо
снять кладовку в москве

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(10.12.2016)