03

агрегация 124

катализ 278

свертывание 179 Реакции скорость 277, 278 Реверсивные повороты 91, 92, 204

как точки изгиба 102, 153

обилие в белках 160

предсказание 129

частота встречаемости 131, 132, 144

Релейно-зарядная система 248 275, 276

Ренатурация 177, 182 Рибонуклеаза поджелудочной железы 35, 39, 89, 136, 181

комплементация 184

предсказание структуры 151

свертывание 177. 182

эволюция 201, 202, 210 Рибонуклеиновая кислота (РНК) 9,

19 59, 95 Рибосома 14, 118, 270 Рибосомальная РНК 12, 229, 270 Рибосомные белки 14, 72, 270 Ричардса оптический компаратор 165 РНК см. Рибонуклеиновая кислота

Россмана шпильки 101, 111, 115, 231, 260

Рубредоксин 46, 108

Салицилат 262 Самообъединение 65, 71, 286 Самопроизвольное свертывание 13,

14, 36, 38, 177 Саркомер 284

Саркоплазматическнй ретнкулум 267,

285, 288 Сближенность 278, 282 Сверхвторичиые структуры 97, 116,

126

Сверхпредсказание 147 Свертывания белка

единицы 106, 114

моделирование 57, 192, 207, 238

процесс 22, 106, 123, 154, 177,206

центры 154, 185, 206 Свободной энергии изменение 48 при ассоциации 123

— переносе 22, 38, 53, 123

— присоединении лигандов 246, 274 ?— свертывании 48, 194 Ig-Свертывание 62, 220 02-Связывание 256

Связывание, центры быстрый распад 77 кофакторов 60, 171, 259, 278 между субъединицамн 256, 264, 271', 280

представление с помощью моделей 163, 164, 171 примеры 62, 114, 116, 243 сохранение в ходе эволюции 201 Связывающая энергия (свободная энергия связывания) 262, 274 Связывающая энергия (связывающая

энтальпия) 38, 48, 178 Серии 10, 11, 20, 79

в сериновых протеазах 248, 274, 275

Сериновые протеазы 116, 216, 246 каталитический механизм 275 8-структуры 102, 109, 114, 115, 231

функциональное разнообразие

198, 216, 283 Сжимаемость белков 57 Сигмоидальное присоединение 257,

289

Сигнальный пептид, гипотеза 73

Симметрия 111

линейные группы 83, 111, 118 пространственные группы 118, 284

точечные группы 111, 113, 118 Сиитетаза жирных киелот 155, 228 Синтетические гомополимеры 129, 295 Снитетнческие полипептнды 243, 246 Скелетная мышца 283 Слейтера потенциал 39 Слияние на уровне гена 227 (З-Слой 93

в иуклеопротеидах 271

листы 95, 142, 264

область иаФф-карте 31

определение 102

параметры 85

полости 112, 114, 116, 218, 230

предсказание 129 представление 170 примеры 114, 259, 260 склонности 132 сравнение 240, 261 топология 240

у поверхности раздела белок —

белок 121 ширина 95 Случайная конформация цепи 49,

177, 184 Солевой мостик 38, 54, 125 в активных центрах 248 — гемоглобине 202, 256 Сократительный аппарат 282, 286 Сократительный белок 68, 284 Сохранение в процессе эволюции внутренней части белка 201, 217 генетического кода 17 глицильиых остатков 20, 204 каталитических центров 201 процесса свертываиня 207 свертывания 197, 207, 217, 222 Специализированные белки 198 Специфичность 72, 125, 243, 248, 269, 274

Спираль (a, aL, Зю, я) 83 Спираль 31, 32, 85

зарождение 137, 143 инициация 206 как диполь 43, 264 методы предсказания 129, 192 область наФ^-карте 31, 131, 295 остатки, образующие 129, 130 — нарушающие 129, 130, 135 роль в качестве зародыша свертываиня 185, 192 склонность 130, 131 содержание в белках 129, 150 Спираль—клубок, переход 139, 293 Стандартная вероятность 235 Стандартная значимость 235 Статистический вес 96, 100, 136, 293

относительный 138, 300, 302 Стереоизображения 62, 114, 164, 168 Структурно-специфичные лекарства 283

Структурные зоны ДНК 59, 200 Структурные макеты 169 Структурные повторения 111, 159,

230, 237 Структурные флуктуации 180 Структурный домен 59, 103 Структурный класс 107 Структурный мотив 111, 113 Субстрат 170, 201, 211, 246, 274 Субтилизин 93, ПО, 233, 246 Субтилизина ингибитор 109 Суб'ьедииицьг 63, 190

диспропорционироваине 66

контакты 120

определение 61

симметрия агрегатов 120 Суперсцирализация а-спиралей 97,. 287

Суперспираль 89, 97

Сывороточный альбумин 64, 139, 231

Ф ^-Таблица 135

Таксономия 212, 227

Температура перехода 139, 300

Тенденции к встраиванию (во вторичную структуру) 130, 302

Тепловые флуктуации 180

Теплостойкие белки 201

Термодинамическая гипотеза свертывания 180

Термолизии 108, 109, 233

Тетраэдрический иитермедиат

Тиамиипирофосфат 279

Тимндии-3,5-дифосфат 190

Тиолдисульфидный обмен 68

Тиоредоксии 69, ПО

Тнрознл-тРНК-синтетаза 97, 108, ПО*

Тирозин 10, 11, 20, 46, 181

Тканевой совместимости антигены 63,. 219, 220

Токсины 68, 282

Топологическая взаимосвязь 213 Транскрипция 9 Трансляция 9, 15

Трансплантации антиген см. HL-A-Белки

Треоиин 10, 11, 20, 79, 268

Треоииидезамииаза 68, 191

Тригоиальиая диаграмма 120

Трнозофосфагнзомераза (ТШ) агрегация субъедиииц 119 связывание фосфата 264 структура 61, ПО, П2, 115, 116Трипсин 107, 112, 114, 232 дисульфидные связи 68 комплекс с БПТИ 122, 124, 126, 248

проверка компактности свертывания 183

родственные связи 216

специфический про