химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

dlnZ dlnXf TV ? s д\г AT Xx - 1 / л 1 Kv

(л)= = « —-— = ? — = N—- (A. 15)

Z ds dins dins /.г ds Xa— A2

<л) есть переменная величина, экспериментально наблюдаемая при переходе спираль — клубок. Теоретические кривые для (л) как функции s построены для нескольких значений о* на рис. A.I,а. Если s = 1, то при всех значениях о половина остатков имеет спиральные конформаций. Чем меньше о, тем резче переход при s ~ \> т. е. тем сильнее выражена кооперативность.

Число и длина спиральных сегментов

Наибольшее число спиральных сегментов отвечает точке перехода. В уравнении (А. 13) величина v означает число спиральных сегментов в данной конформаций цепи. Среднее число спиральных сегментов (v).

(А. 1б>

Jmmi Z dins ~ д\пз Хх (Хх — Х2)

по всем конформа-циям цепи

Эта функция, показанная на рис. А.1, 6\ имеет максимум при s = 1. Число сегментов уменьшается с уменьшением о. Средняя длина спирального сегмента (/) равна

Рис. АЛ.

Модель Зимма — Брэгга перехода спираль — клубок в полипептидной цепи длиной Л'. Рядом с кривыми указаны значения а.

а — средняя доля спиралей как функция относительного статистического веса s. б — отношение среднего числа спиральных сегментов к N как функция s. в — отношение средней длины спиральных сегментов к N как функция s.

(О =

>-1

1-Х,

У а У а

(А Л 7)

Как видно из рис. АЛ, в, длина спирали монотонно растет с увеличением s.

Необходимо отметить, что разделение цепи на несколько сегментов спиральной и клубковой конформаций согласуется с более общим рассмотрением Ландау и Лифшица [791]. Авторы утверждают, что в одномерном случае разделение на две отдельные фазы невозмож

1expi~kY)d^dl j* exp(^r) d4d'№

а клубок область ^ E )клубок ДЯ

RT* RT2 ~ RT'1

(A. 18)

Таким образом, в области перехода (s ~ 1) относительное изменение sв зависимости от Т приблизительно постоянно, т. е. изменением приблизительно пропорционально изменению температуры (рис. А.2).

Температура перехода . .

Температура перехода приблизительно пропорциональна изменению энтальпии. Переход происходит при s — 1, то есть при z'1 = =zc или

а. КЛубоК

Если принять, что Е — ELL = const по-всей a-области размера Qa и Е = Ес — const по всей области клубка размера Qc, то

S.exp(^) = Scexp(^

Переходы происходят лишь в тех случаях, когда состояние с более низкой энергией занимает меньшую конформационную область. При Qc > 2а температура перехода становится отрицательной, если энергия а-конформации менее выгодна, чем энергия конформаций клубка, Еа> Ес. Кроме того, переходы совершаются

т

Рис. А.2.

Связь между относительным статистическим весом s, температурой Т и разницей энтальпий АЯ вблизи точки перехода (s = 1, Т — 0) для двух различных полимеров.

Это — графическое представление уравнений (А.18) и (А.19). Обе величины Д//(') и Д//(2) отрицательны и Д//(2)<Д//С). Различие температур перехода 6(2)—ЮС) пропорционально разности ДЖг)— ДЯС). При данной температуре Та оба полимера имеют различные относительные статистические веса s(') н si2). Эти значения s определяют склонности полимеров к образованию спнралн при данной температуре.

в том случае, когда состояние с меньшей энергией Е (более прочное связывание) занимает меньшую конформационную область Q. В нашем примере, когда Qc> 2а (рис. 2.3), спиральная конформация принимается, только если она энергетически выгодна. Направление перехода таково, что при температурах ниже 8 превалирует состояние с меньшей энергией, а при температурах выше 6 —состояние с большей конформационной областью (рис. А.2). Чем выше температура перехода 9, тем меньше различие конформационных областей и тем больше энергетически выгодных спиральных конформаций.

А.5 Сравнение с экспериментальными данными

Кривые перехода спираль — клубок и модель Зимма — Брэгга

Экспериментальные кривые перехода спираль — клубок описываются с помощью модели Зимма — Брэгга. Для апробации модели Зимма — Брэгга теоретические кривые перехода спираль — клубок (уравнение (А. 15)), показанные на рис. АЛ, а, следует сравнить с экспериментальными. Если содержание спирали (п) измерять, как функцию температуры 7\ получаются сигмоидные кривые, аналогичные показанным на рис. АЛ, а. Для сравнения температуру Т нужно перевести в относительный статистический вес s. В области перехода Т приблизительно пропорциональна s (разд. А.4 и рис. А.2). Если известна разность энтальпий АЯ перехода, Т можно заменить на s, пользуясь уравнением (АЛ8). Затем полученную экспериментальную кривую перехода (п) как функцию s можно сопоставить с теоретической кривой с соответствующим параметром нуклеации а. В большинстве случаев получается вполне удовлетворительное совпадение, что и подтверждает модель Зимма — Брэгга.

Приближенные значения з для синтетических полимеров

1 д (п) N ds

В случае перехода спираль — клубок, индуцируемого изменением температуры, параметр нуклеации можно оценить по наклону кривой в

страница 118
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
вр-кв 300х100
гироскутер поменять корпус
http://taxiru.ru/zakon69-2/
театр романа виктюка отзывы

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(20.08.2017)