химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

ротеидов [709, 713]. Сахара действительно являются подходящими элементами образования некоторых специфических структур [85]. Если из трех различных аминокислот можно составить только шесть различных пептидов (используя все перестановки), то из трех сахарных остатков можно образовать по меньшей мере в десять раз больше первичных структур; в связи с этим многие из возможных объединений моносахаридов используются in vivo. Однако механизмы узнавания с участием сахарных остатков часто основываются скорее на стохастических, чем на стехиометрических процессах, поскольку синтезу сложных углеводов недостает точности белкового синтеза.

Нуклеопротеиды

Этим термином мы обозначаем все белки, которые взаимодействуют не только с моно- или динуклеотидами, как, например, ферменты, рассмотренные в разделе 10.4, но и с целыми нуклеиновыми кислотами.

Рибосомы — комплексы белков и нуклеиновых кислот. Хорошо известным примером комплексов белков с нуклеиновыми кислотами является рибосома, катализирующая образование полипептидных цепей [714, 715]. Рибосома содержит несколько молекул РНК и различные белковые молекулы. Она состоит из двух субъединиц неодинаковой величины, между которыми заключена рибосомальная РНК- В Е. coll более крупная субъединица содержит две молекулы РНК (названные «23S» и «5S» в соответствии с их константами седиментации) и 34 молекулы белков, названные от «Ы» до «L34». Более мелкая субъединица содержит РНК «16S» и 21 белок (от «S1» до «S21»).

Многие из этих белков прочно связаны с нуклеиновыми кислотами. Некоторые белки настолько вытянуты [7], что число их внешних контактов с нуклеиновыми кислотами и другими рибосомными белками намного превосходит число внутримолекулярных контактов. Поэтому сама по себе полипептидная цепь не может принимать определенной структуры. Очень маловероятно поэтому, чтобы эти белки можно было закристаллизовать и подвергнуть структурному исследованию. До сих пор удалось закристаллизовать только фрагменты белка L12 (и/или белка L17), который легко отделяется от рибосомы и, по-видимому, способен сам по себе образовывать определенную структуру. Ведется его рентгеноструктурнсе исследование [716].

Фактор элонгации Ти • GDP по форме напоминает головастика. Удалось также закристаллизовать фактор элонгации Ти • GDP, который образует с рибосомой и тРНК тройной комплекс [717]. Его структура определена с разрешением 6 А [718]. Форма молекулы заметно отличается от формы обычных глобулярных белков. Это — «головастик», состоящий из глобулярного домена («головы») и удлиненного тонкого домена («хвоста»), разделенных расщелиной с меньшей плотностью. Голова содержит несколько а-спиралей и, по-видимому, имеет довольно жесткую структуру. Хвост, напротив, более лабилен и, по-видимому, представляет собой ^-структуру. Интересно, что голова и хвост имеют и второе сочленение, так что в результате возникает некая циклическая структура. Вероятно, тРНК присоединяется вблизи отверстия этого цикла в большом желобе между доменами. Хорошо видно относительнее смещение доменов во время стадии элонгации на рибосоме. Деление на подвижный и жесткий домены обнаружено также для нуклеопротеидов L7/L12 [716] и lac-penpeccopa [719]. В L7/L12 подвижный домен находится со стороны N-конца.

Аминоацил-тРНК-синтетазы также участвуют в синтезе белка. Однако эти ферменты взаимодействуют не с рибосомой, а только с тРНК- Известно свертывание цепи для одного из этих ферментов [221]. Оказалось, что фермент представляет собой симметричный димер и не отличается существенно от других глобулярных белков. Предполагалось, что центр связывания тРНК образован сбеими субъединицами, что напоминает ситуацию, наблюдаемую в других ферментах, связывающих более мелкие субстраты [124, 313].

Большой интерес у молекулярных биологов вызывают белки, контролирующие экспрессию генов путем ассоциации с ДНК. Один из этих белков — lac-репрессор — удалось закристаллизовать; сейчас продолжается исследование его пространственной структуры [719].

Таким образом, наши представления о взаимодействиях между белками и нуклеиновыми кислотами пока еще очень ограниченны. Как было отмечено, важную роль в этих взаимодействиях могут играть (З-структуры [206—208]. Примеры рибосомальных белков и фактора элонгации Tu * GDP показывают, что некоторь е нуклео-протеиды имеют весьма своеобразную структуру.

Заключение

Нормальная деятельность живых организмов возможна только благодаря тому, что природный белок не проявляет присуней поли

пептидам способности присоединять все виды малых молекул, но специализируется только на нескольких определенных видах. Лишь один тип белков, иммуноглобулины, имеет максимально возможное число центров присоединения. Поэтому систематический анализ систем иммуноглобулин — лиганд позволяет выяснить общие принципы взаимодействий белок — лиганд. Архитектура иммуноглобулинов может также служить основой для синтеза in vitro полипептидов с желаемыми свойствами.

Живые организмы включают огромное число разнообразных низкомолекулярных соедине

страница 106
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
Вся техника в KNSneva.ru RB2011UiAS-RM - Санкт-Петербург, ул. Рузовская, д.11, тел. (812) 490-61-55.
как определить какой шкаф установит на вентиляции ned
билеты на спектакль бешеные деньги
благодарность за помощ

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(28.07.2017)