химический каталог




Принципы структурной организации белков

Автор Г.Шульц, Р.Ширмер

изменениями фосфопро-теида [175, 693], хорошо коррелирует с тем фактом, что в лактатдегидрогеназе [232] и в аденилаткиназе [688] петля является эпицентром больших конформационных изменений. Таким образом, исследования нуклеотидсвязывающих белков могут способствовать прояснению статических и динамических аспектов фосфорилирования белков.

Таблица 10.2

Центры присоединения фосфата в нуклеотидсвязывающих белках и в

фосфопротеидах

Белок

Последовательность

Примечание

Миелиновый основной белок

Гистон Н2а Гистон Н4 Гистон HI Гликогенсинтетаза Тропой и н I НРг-фактор [720]

Флаводоксин [Н5]

Аденилаткиназа [665]

Глицеральдегид-3-фосфатдегидро-геназа [145[

G-Ser(P)-G-K-D

Ac-Ser(P)-G-R-G Ac-Ser(P)-G-R-G G-Ser(P)-F-K-L I-Ser (P)-V-R-X I-Thr(P)-A-R-R I-His(P)-A-R-P

10

G-Thr-G-N-T

20

G-Ser-G-K-G

R-IIe-G-R-L

Фосфопротеиды; (P) означает обратимо фосфорилируемый остаток; данные из работы [693]

НРг участвует в направленном фосфорилировании. Типичная топология петли, связывающей фосфат, предсказана по аминокислотной последовательности

Эта петля охватывает фосфатный фрагмент FMN

Петля охватывает Р-фрагмент АМР: в ней происходят основные конформационные изменения

Амиды Arg-10 и Не-II остова образуют водородные связи с пирофосфатным фрагментом NADH

10.6 Взаимодействия белков с другими макромолекулами

Белки могут специфично взаимэдействэвать с другими макромо* лекулами, например с нуклеиновыми кислотами и полисахаридами. К макромолекулам относят также липкды, поскольку они образуют в водных растворах крупные агрегаты. В нуклеопротеидах, глико-протеидах или липопротеидах белок может составлять менее 50%, и суммарные свойства комплексов часто определяются небелковыми фрагментами. Более того, и образование, и стабильность структуры белков могут зависеть от их партнеров по комплексам. Эго наиболее очевидно для тех мембранных белков, которые соединяют различные углеводородные фрагменты липидного бислоя.

Лнпопротеиды

Белки проникают сквозь поверхность раздела водной и неполярной фаз. На взаимодействиях белков и липидов основаны две важные биологические функции: транспорт липидов в водных растворах и мембранная активность. Способность к транспорту в плазме крови обычно труднорастворимых липидов, например холестерола (2 мг растворимы в 1 л 150 мМ раствора NaCl, рН 7,4), или триацилглице-ридов увеличивается в 1000 раз за счет образования специфических липопротеидов. Такие липидтранспортирующие белки могут играть роль в атеросклерозе и других заболеваниях, с чем и связано большое число посвященных им работ [145, 694]. Немалый интерес проявляется также к вторичной и третичной структурам липопротеидов. Предпринимались попытки предсказания их структуры на основе корреляции (гл. 6) между вторичной структурой и аминокислотной последовательностью обычных глобулярных белков [694]. Поскольку закристаллизовать липопротеиды достаточно трудно, по-видимому, более точных структурных данных в ближайшем времени получить не удастся.

В мембранах липиды образуют биологические барьеры и оболочки, тогда как специфические функции мембран, такие, как, например, транспорт, передача сигнала и преобразование энергии, выполняются белками [19, 695—697]. Информация об аминокислотных последовательностях во внутримембранных частях белков крайне ограниченна; известно, что в них имеются довольно протяженные участки неполярных остатков [698]. Наиболее подробная информация о третичной структуре получена для мембранного белка из На-lobacterium halobium [699, 700]. Субъединица этого белка состоит в основном из семи параллельных или антипараллельных а-спиралей, вытянутых от одной поверхности мембраны до другой. Другая хорошо исследованная система обсуждается ниже.

Кальциевый насос — типичный хорошо исследованный мембранный белок. Саркоплазматический ретикулум из мышц [701, 702] представляет собой трубчатую систему с высокоспецифической мембраной, единственная функция которой состоит в освобождении и накоплении ионов кальция [703, 704]. Это отражается в том обстоятельстве, что один белок с молекулярной массой 100 000 так называемый Са2+-транспортирующая АТРаза или Са2+-насос, составляет более 50?о массы мембраны и 80?о общего содержания белков в мембране. Этот белок, представляющий собой цилиндр диаметром

о о

50 А и длиной 80 А, проходит через весь слой мембраны толщиной

о

от 60 до 90 А. Мембрана включает 90 (фосфо)липидных молекул на одну молекулу Са2+-насоса.

Очевидно, мембрана и Са2+-насос образуют функциональную единицу, где мембрана служит барьером, препятствующим возврату накопленного кальция. Кроме того, мембрана является двумерным растворителем белка: как показано в опытах по связыванию липида с очищенным белком, поверхность транспортирующей Са2+ АТРазы имеет большее сродство к неполярной среде, чем к воде.

Поскольку существует только один тип воды, но много типов молекул липидов, этот широкий спектр липидных молекул обеспечивает большое разнообразие специфических взаимодействий с мембранными белками.

страница 104
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151

Скачать книгу "Принципы структурной организации белков" (3.40Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
заказ микроавтобуса на свадьбу москва
реклама световая объемные буквы
вентилятор канальный vr 60-30/28.4e цена в краснодаре
запашные елка

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(19.11.2017)