оединяющих «палочек», если не делать последние слишком длинными (удобно брать масштаб 2 см = 0,1 им), нельная проволока удерживает шарики без клея и удобнее, чем зубочистки или деревянные шпонки. Однако для пользования этой проволокой нужно иметь хорошие кусачки.

Сделайте пометку на шарике здесь

и здесь

В табл. 2-1 (том 1, стр. 68) приведены длины межатомных связей. Угол, образуемый двумя связями (т. 1, стр. 68), лучше всего обозиа^ чить на поверхности шарика с помощью картонной пластинки (шаблона), как показано ниже (обычно достаточно одного шаблона для угла 120° и второго для угла 109,5°); пластинку вырезают таким образом, чтобы она прилегала к шарику, а два ее конца были направлены иа центр шарика. Если три пластинки с углом 109,5° скрепить по краям так, чтобы получился треугольник, то сразу определяются три точки на образующем тетраэдр атоме углерода. Очень удобно временно пометить эти точки с помощью зубочисток.

Атомы можно раскрасить в следующие цвета: водород — в белый, углерод — в черный, кислород — в красный, азот — в голубой, серу — в желтый. Используя шарики из пенопласта, следите, чтобы эмаль не растворяла их. Очень удобны аэрозольные баллончики с эмалью (такие баллончики выпускаются теперь без фреона). Опрыст кивайте набор шариков, поместив их в коробочку и часто встряхивая, чтобы они переворачивались,

ЭЖ;^Приложение

Б. Пространственные модели

Б этих моделях радиусы атомов приближаются к вандерваальсовым радиусам (табл. 2-1, том 1, стр. 68). Практически не удается сделать модель с радиусами именно этой величины из-за слишком плотной упаковки, затрудняющей сборку. Компромиссное решение, позволяющее получить неплохие на вид молекулярные модели, состоит в том, что для изображения атомов С, Н, О и N используются пенопластовые шарики диаметром 3,8 см, а для атомов Р и S — диаметром 5,1 см. Если отрезать по 0,5 см от шариков, представляющих С, О и N, со стороны каждой связи, то остающиеся 1,4 см будут соответствовать примерно величине ковалентного радиуса 0,07 нм при масштабе 2 см = 0,1 нм (1 А). От шариков, изображающих атомы водорода, отрезают 1,3 см и таким образом получают необходимую величину ковалентного радиуса 0,03 нм. 1,9 см радиуса шариков соответствует 0,095 нм, т. е. примерно г/'з действительных вандерваальсовых радиусов С, N и О и 0,8 радиуса водорода. Удобно также использовать масштаб 1,25 см = 0,1 нм. Именно такой масштаб применен в имеющихся в продаже «СРК-моделях», разработанных American Society of Biological Chemists inc. Если использовать этот масштаб, то можно комбинировать самодельные и готовые модели. Для изображения атомов Н и С, берут шарики диаметром 2,54, а для О и N — 3,8 и 3,18 см соответственно.

Обрезать шарики при постройке пространственных моделей следует аккуратно, соблюдая величину ковалентного радиуса. Проще всего сделать так: центры, участков, которые нужно срезать, сначала помечают, втыкая в шарик зубочистки. Если должен получиться тетраэдр, то соответствующие точки определяют с помощью картонной пластинки, как описано выше. Шарики обрезают, помещая их в отверстия, прорезанные в металлическом листе, причем диаметр этих отверстий должен быть таков, чтобы с другой стороны металлического листа выглядывала точно та по размеру часть шарика, которую следует отрезать. Эту выступающую часть шарика срезают очень острым ножом. Отверстия в металле, например в алюминии, нужно вырезать с большой точностью, но время, потраченное на изготовление такого шаблона, не пропадет, так как шаблон долговечен.

Большие плоские химические структуры типа нуклеотидных пар в ДНК можно вырезать из пенопластовых пластин.

В. Картонные модели

Многие биологические «макромолекулы» типа белков или нуклеиновых кислот состоят из такого огромного количества атомов, что сборка их модели из отдельных шариков и трудоемка, и дорога. В таких случаях прибегают к макетам из картона (металла или пластмассы). Например, для изображения планарной пептидной единицы можно сделать макет (рис. П-1), исходя из размеров, приведенных на рис. 2-3 (т. 1, стр. 88). Довольно сложно рассчитать угол, под которым следует делать сгибы для воспроизведения углов Ф и (см. рис. 2-4 и табл. 2-3). (Гораздо легче решить эту задачу непосредственно путем геометрического конструирования, используя кусочки картона.) Таким способом можно создать очень красивые спиральные структуры (некоторые примеры приводит Карлсон [1])- При необходимости к а-углерод-ным атомам можно приклеить пенопластовые боковые цепи. При этом можно расположить спиральную модель на поверхности картонного цилиндра и украсить пенопластовыми боковыми цепочками.

РИС. П-1. Образец для изготовления картонных моделей полипептидов. Масштаб

2 см : 0,1 нм.

Для конструирования спиралей ДНК и РНК плоские пары оснований, сделанные из картона (а еще лучше—из более плотного материала), нанизывают на проволоку, изображающую ось, а в качестве распорок используют кусочки резиновой или полиэтиленовой трубки. Для изображения сахарофосфатного остова можно вз