химический каталог




Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 2

Автор Д.Мецлер

тсутствие второго субстрата [75]. Милдваи [67] высказал предположение, что эти фосфоферменты образуются в результате побочных реакций, свидетельствующих о существовании промежуточных метафосфаткых соединений.

Недавно описаны трехмерные структуры дрожжевой гексокиназы (рис. 7-5,Л) [76], фосфоглицераткиназы, состоящей из 355 аминокислотных остатков (рис. 7-5,5) [77] и аденилаткиназы (дополнение 3-А) [78]. Последний фермент, мол. вес которого составляет ~ 22 ООО, имеет среди всех известных киназ наименьший размер молекулы. Во всех трех случаях молекула белка состоит из двух долей (или, иначе, домеБ

РИС. 7-5. А. Схематическое изображение полипептидной цепи субъедииицы дрожжевой гексокииазы В. Место связывания глюкозы обозначено буквой G, а место связывания AMP — буквой А. Места связывания АТР в области между двумя субъединицами в различных типах кристаллов обозначены буквами Iu и Id (по Флеттерику и др. [76]). Б. Изображение молекулы фосфоглицераткиназы. Цилиндры, представляющие се-спи-ральные отрезки цепи, пронумерованы римскими цифрами, начиная с К-конца«. Стрелками представлены индивидуальные цепи в р-структуре и их направление. Стрелки обозначены буквами в алфавитном порядке, начиная с N-конца. Домен, связывающий АТР, находится в нижней части рисунка (по Блейку и Эвансу [77]).

нов). Для фосфоглицераткиназы и аденилаткиназы установлено положение АТР-связывающего центра. Оказалось, что две ближние к адено-зину фосфатные группы Ра и Рр связываются одним и тем же доменом (нижний домен А на рис. 7-5,Б), а концевая фосфатная группа АТР (Pv) попадает в щель между двумя доменами. Ион Mg2+ связывается с Ра и Рр так, как это показано на схеме (7-23).

Большой интерес в настоящее время вызывают протеинкиназы (гл. 6, разд. Е,2), которые катализируют перенос фосфатных групп от АТР к гидроксильным группам определенных остатков серина или треонина в

молекулах своих субстратов. Характерной особенностью центров фос-форилнрования в субстратных белках является присутствие остатка лизина или аргинина в положении, отделенном от серина или треонина только одним аминокислотным остатком [78а].

Планарный нитрат-ион по своему сильному ингибирующему действию, обусловленному прочным связыванием, и по ряду других свойств может рассматриваться как аналог переносимой фосфатной группы в ?тригональных бипирамидальных переходных состояниях [уравнение *{7-20)] для реакций, катализируемых киназами [78Ь]. Еще один ион, шредставляющий интерес как высокореакционноспособный аналог фос-«фат-иона,— это феррат-ион FeO*". Будучи сильным окислительным .агентом, феррат-ион сходен в то же время с фосфат-ионом по структуре .и кислотно-основным свойствам и может быть использован для модификации фосфат-связывающих центров [78с].

7. Ядерная релаксация, индуцированная парамагнитными ионами

Использование парамагнитных ионов (например, Mn2+, Си2+ или >Сг3+) для индукции ядерной релаксации в молекулах субстрата н ко-фермента, находящихся в активных центрах ферментов, является очень эффективным методом исследования. Область применения этого метода непрерывно расширяется [79—83]. Для этих целей могут служить так-.же флавиновые радикалы и избирательно вводимые иминоксильные спиновые метки. Парамагнитные ионы, как хорошо известно, оказывают влияние на магнитную релаксацию соседних ядер (см. дополнение 5-А). Так, небольшие количества Мп2+ в образце вызывают уширение линий, соответствующих 1Н, 13С и 31Р в обычных спектрах ЯМР.

Ценную информацию о ферментах можно иногда получить из анализа сигнала ЯМР протонов в воде (растворителе). Время релаксации протонов свободной воды обычно больше 1 с. Однако протоны координационно связанных молекул воды в ионе Мп(Н20)б+ характеризуются гораздо более высокими скоростями релаксации (значения Т\ и Г 2 порядка 10~5 с). Поскольку координационно связанные молекулы воды •обычно очень быстро обмениваются с молекулами окружающей среды, небольшое количество ионов марганца может вызвать существенное повышение скорости релаксации протонов всех молекул воды. При этом • с помощью подходящих методов можно наблюдать уширение линии протона в спектре ЯМР и изменения величин Т\ и Т2. Известно, что сила ноздействия парамагнитного иона на магнитную релаксацию соседнего ядра обратно пропорциональна межъядерному расстоянию в шестой степени. Принимая, что в гидратированном ионе Мп2+ расстояние между Мп2+ и Н равно 0,287±0,005 нм, можно найти количественные соотношения между изменениями величин Т\ и 72, с одной стороны, и чис-.лом молекул воды, входящих в координационную сферу связанного бельком иона металла в любой фиксированный момент времени, и скоростью «х обмена с молекулами растворителя, с другой стороны.

Хотя регистрация изменений магнитной релаксации ядер 1Н, 13С и 31Р наталкивается на еще большие трудности, подобные измерения могут дать чрезвычайно полезную информацию о геометрии активных центров. Расчеты опираются на ту закономерность, что воздействие на релаксацию ядра убывает с ростом межъядерного расстояния г пропорциона

страница 59
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267

Скачать книгу "Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 2" (6.26Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
аренда звуковых систем
Фирма Ренессанс лестницы для маленьких проемов - доставка, монтаж.
кресло престиж кожзам
Самое выгодное предложение от магазина компьютерной техники КНС Нева - асер компьютер цена - в кредит не выходя из дома в Санкт-Петербруге, Пскове, Мурманске и других городах северо-запада России!

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(10.12.2016)