химический каталог




Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 1

Автор Д.Мецлер

ия Y (см. рис. 15-10), которое расположено непосредственно над антнкодоном. Его боковая цепь находится в дальней от нас части изображения. Непосредственно перед антико-доном, в 5'-«половине» молекулы, расположены два неспаренных основания (С и U). 2'-гидроксильные группы цитидина и входящего в состав антикодона гуанозина метилированы. Двигаясь вверх вдоль петли антикодона, мы проходим два триплета оснований, в которых реализуется схема спаривания ках Уотсона — Крика, так и Хугстена. Рекомендации относительно того, как рассматривать такие рисунки, даны в подписи к

рис. 2-6. (С любезного разрешения A. Rich.)

от нормали к оси спирали примерно на 20°, тогда как в В-форме, реализуемой при высокой влажности, плоскости почти перпендикулярны оси спирали (торсионные углы остова составляют сй=155°, | = 36°, 9 = —146°, ф = —96° и \р = 46°) [65]. Считается, что ДНК внутри клеток находится в основном в В-форме.

Если пренебречь асимметрией пары оснований, то можно заметить, что в составе двойной спирали одна нуклеотидная цепь связана с другой осью симметрии 2-го порядка. Этот элемент симметрии, порождаемый антипараллельным расположением цепей, делает молекулу ДНК с обоих концов одинаковой — как с точки зрения человека, рассматривающего модель, так и с точки зрения фермента, вступающего с молекулой во взаимодействие. В действительности две цепи не идентичны, а генетическая информация может считываться с тех участков, которые располагаются на поверхности в районе большой бороздки (рис. 2-23,Л).

1 В действительности мы имеем здесь дело с семейством близких форм.

Приведем некоторые данные о размерах двойной спирали (рис. 2-23). Диаметр ее, определяемый расстоянием между атомами фосфора, равен в точности 2,0 нм. Шаг спирали—3,4 нм, на один виток приходится десять пар оснований. Таким образом, расстояние между плоскостями оснований равно 0,34 нм, что примерно эквивалентно сумме вандерва-альсовых радиусов ароматических колец (табл. 2-1). Таким образом, основания уложены в виде стопки в центре спирали. Типичный ген в 1000 оснований — это участок ДНК около 340 нм длиной (рис. 2-23, Б).

Как и подобает матрице, с которой снимаются копии, двойная спираль ДНК исключительно стабильна. Несмотря на большую длину, в природных условиях она расщепляется крайне редко. Такая стабильность структуры обусловлена несколькими факторами: 1) наличием водородных связей между основаниями; 2) вандерваальсовым притяжением плоских оснований, уложенных параллельно одно над другим; 3) присутствием на поверхности молекулы многих атомов кислорода, отрицательно заряженных и нейтральных, способных к образованию водородных связей с водой или со специфическими белками, окружающими молекулу; 4) способностью к образованию различного рода суперспиралей (см. ниже).

Как мы отмечали выше, ДНК может переходить в паракристалличе-скую А-форму (с наклонным расположением оснований и 11 парами оснований на виток). Напрашивается вывод, что и в природных условиях эта конформация не менее важна, чем В-форма. Хотя молекулы РНК обычно одноцепочные, они часто образуют шпильки — двухце-почечные участки, находящиеся в А-форме [71]. В-конформация в этом случае исключается присутствием ^'-гидроксильных групп в рибозе РНК. Считается, что в клетках образуется также и переходная «гибридная» двойная спираль, составленная из молекул ДНК. и РНК, которая, по всей видимости, тоже ограничена рамками А-формы. Следует отметить, что А-форма отличается от В-формы еще и тем, что имеет довольно большую ( — 0,8 нм в диаметре) полость вдоль оси спирали, а большая бороздка у нее более глубокая [71а]. В отличие от структуры, изображенной на рис. 2-23, в А-форме плоскости пар оснований не пересекают оси спирали.

Наиболее тщательно изучена структура низкомолекулярной тРНК. Во всех этих молекулах существуют двухцепочечные участки, стабилизированные водородными связями с образованием трех шпилек, к которым иногда добавляется четвертая .(«клеверный лист»). Структура одной из тРНК установлена методом рентгеноструктурного анализа [72—74] (рис. 2-24). Нерегулярность и сложность формы молекулы ставит ее в один ряд с молекулами глобулярных белков. Обратите внимание на расположенный в нижней части рисунка антикодон (триплет оснований), структура которого обеспечивает спаривание с тремя основаниями кодона, детерминирующего определенную аминокислоту, в данном случае фенилаланин.

6. Пары оснований

Структура пар оснований в том виде, как это было предложено Уот-соном и Криком, изображена на рис. 2-21. Хотя дифракционные данные показывают, что в ДНК присутствуют именно такие пары оснований, рассматривались и другие варианты. На рис. 2-25 изображены очертания пар оснований с указанием групп, способных к образованию водородных связей. Число групп, которые в качестве доноров или акцепторов электронов могли бы участвовать в этом процессе, получается до

вольно большим, а следовательно, может быть несколько вариантов спаривания оснований. Один из таких вариантов предложил Хугстен (здесь показана соо

страница 53
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176

Скачать книгу "Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 1" (5.5Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
Стол компьютерный СК-28Б
медцентры где получить справку на оружие 046-1 в вао
разделочные доски германия
елка 2016 билеты официальный сайт

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(09.12.2016)