химический каталог




Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 1

Автор Д.Мецлер

ию спирали, данную группу можно рассматривать как центр спирализации. От этого центра спираль разрастается в

Таблица 2-4

Классификация аминокислотных остатков по их способности к образованию

а-спирали, ^-структуры и р-изгибаа

Аминокислота Pa Тенденция к образованию спирали Тенденция к образованию р-структуры pi

Glu- 1 ,53 0,26 анти,4~ 0,44

Ala 1 ,45 0,97 сл. 0,57

Leu 1 ,34 1,22 4- 0,53

His+ 1,24 + 0,71 анти, 0,69

Met 1,20 + 1,67 4-+ 0,67

Gin 1,17 4- 1 ,23 + 0,56

Trp 1,14 4- 1,19 4- 1,11

Val 1,H + 1,65 0,30

Phe U2 + 1 ,28 + 0,71

Lys+ 1 ,07 сл. 0,74 анти. 1,01

He 1,00 » 1,60 +4- 0,58

Asp- 0,98 безр. 0,80 +4- 1,26

Thr 0,82 » 1 ,20 + 1,00

Ser 0,79 » 0,72 анти. 1,56

Arg+ 0,79 » 0,90 безр. 1,00

Cys 0,77 » 1,30 1,17

Asn 0,73 анти. 0,65 анти- 1,68

Tyr 0,61 » 1,29 + 1,25

Pro 0,59 анги. 4" 0,62 анти. 1,54

Gly 0,53 » 0,81 безр. 1,68

* Конформационные параметры Ра, Р$ и Pt представляют собой частоты встречаемости данной аминокислоты в составе а-спирали, (3-структуры или (З-изгиба (по данным для 15 белков с известной структурой), деленные на среднюю частоту встречаемости данной аминокислоты в молекуле. Аминокислотные остатки в таблице расположены в порядке убывания их способности образовывать спираль. Символы «4—К», « + », «сл>, «безр.», «анти.» и «анти.-)-» означают, что аминокислота характеризуется соответственно сильной тенденцией к образованию данной структуры, умеренной тенденцией, слабой тенденцией, что ей безразлично, в какой структуре она будет находиться, что она противодействует или сильно противодействует образованию структуры данного типа [29].

обоих направлениях, пока ей не встретится тетрапептид из остатков, препятствующих образованию спирали. Подобным же образом три остатка из пяти, способствующие образованию ^-структуры, играют роль затравки для формирования В-слоя. В этом случае большое значение имеет возможность образования связей с другими участками цепи, отделенными от растущего р-слоя ^-изгибами или участками с нерегулярной конформацией (статистический клубок). Устраивались даже своего рода конкурсы, в ходе которых разные группы исследователей пытались предсказать способ укладки цепи в белках непосредственно перед определением их структур кристаллографическими методами [31].

Недавно Левитг и Хотиа провели классификацию группы белков, в которую они включили 31 белок с известной структурой; получились четыре четко различающиеся структурные группы. (I). а-Белки, в которых, как в гемоглобине и миоглобине, преобладают а-спирали. (II) Белки, построенные из р-слоев, расположенных один над другим и образующих многослойную структуру; в эту категорию, в частности, попадает небольшой белок рубредоксин (рис. 10-4), а также конкана-валин А (рис. 5-7). (III) (хх + р)-Белки, у которых в состав одной и той же полипептидной цепи входят участки, целиком построенные из а-спиралей, и участки, целиком состоящие из р-слоев (как правило, антипараллельных). Примерами таких белков могут служить папаин и термолизин (гл. 7). (IV) а/р-Белки, в которых а-спирали и ^-цепи чередуются по ходу полипептидной цепи. Обычно здесь имеется один центральный р-слой, по обе стороны которого располагаются спиральные участки; такая ситуация имеет место, например, в карбоксипепти-дазе (рис. 2-6), глицеральдегидфосфатдегидрогеназе (рис. 2-10), а также в гексокиназе и фосфоглицераткиназе (рис. 7-5).

5. Дисульфидные мостики

К характерным особенностям структуры молекулы лизоцима (рис. 2-9) относится также присутствие четырех поперечных дисульфидиых связей (дисульфидиых мостиков) между различными участками цепи. Эти мостики возникают самопроизвольно в тех случаях, "когда —SH-группы двух боковых цепей цистеина подходят близко друг к другу и окисляются в присутствии 02 или некоторых других реагентов [уравнение (2-8)]. Дисульфидные связи довольно часто встречаются в белках, секретируемых клетками, и значительно реже образуются во внутриклеточных ферментах. Вероятно, внутри клеток ферменты защищены от многих внешних воздействий и не нуждаются в дополнительной стабилизации.

2 —СН2—SH >~ Н2С СН2— (2-8)

\ / S—S

Один из белков, обладающих наибольшей концентрацией поперечных связей, присутствует в так называемой кератиновой «матрице». Разрушение дисульфидиых связей в этом белке лежит в основе химической завивки волос (перманент). Для этого используется какое-либо тиоловое соединение, под действием которого осуществляется восстановительный разрыв поперечных дисульфидиых связей. После укладки волос окисление на воздухе приводит к образованию новых поперечных связей.

Немаловажное значение имеет геометрия дисульфидиых мостиков. Торсионный угол при S—S-связи равен, как правило, ~90°, но бывают и довольно заметные отклонения от этой величины.

(?) сн2

Ч

Вид вЪоль линии связи S—Я

6. Размеры и форма молекул белка

Как внутренняя структура белков, так и их размеры и форма могут сильно различаться. Некоторое представление об имеющихся здесь возможностях дает рис. 2-12, на котор

страница 41
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176

Скачать книгу "Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 1" (5.5Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
кровать ассоль ас-10 инструкция по сборке
баннер день победы
диана арбенина 20 октября
кузовная покраска мытищи

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(24.07.2017)