химический каталог




Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 1

Автор Д.Мецлер

упп Ь и с аланина, поскольку обе они связаны с центральным атомом через атом углерода. Если атомы участвуют в образовании двойных связей, примером чему служит карбоксильная группа аланина, то они учитываются

1 Иногда к буквам D п L добавляют индексы s или g, указывающие, какое соединение использовано в качестве эталона конфигурации — серии или глицеральдегид (разд. В.1). Обычный треонин является Ls- или Ьг-треонином. Конфигурация правовращающей ( + )-винной кислоты обозначается 2(R), 3(R) или Ds или Lg.

СООН

НСОН I

НОСН

СООН 2(R),3(R)-BHHHaH кислота

дважды — второй раз как воображаемые атомы, продолжающие цепочку связей:

/(®) 4 Воображаемые атомыС ? —С—О—(С) <

Мы не будем рассматривать здесь полный набор всех правил; укажем лишь последовательность, в которой приводимые ниже функциональные группы расположены в порядке уменьшения их приоритета [2]: SH;> > OR > ОН > NHCOCH3 > NH2 > COOR > СООН > СНО > >СН2ОН>С6Н5>СН3>3Н>2Н>Н. Хотя tfS-система вполне однозначна, зачастую два близко родственных соединения, принадлежащих к одной конфигурации в DL-системе, в ^S-системе имеют противоположную конфигурацию. Поэтому при определении конфигурации аминокислот и Сахаров применяется обычно DL-система.

6. Конформации: различные формы, которые может принимать молекула

Помимо определенного расположения ковалентно связанных атомов (конфигурация), не менее важна в биохимии конформация молекулы, которая определяется ориентацией групп, обусловленной вращением их вокруг одинарных связей [3]. Многие группы свободно вращаются даже при комнатной температуре; к примеру, —СНз-группу можно представлять себе чем-то вроде крыла ветряной мельницы, которое случайным образом поворачивается то в одну, то в другую сторону. Однако даже простейшие молекулы имеют какую-то преимущественную кон-формацию, а в более сложных структурах вращение, как правило, в значительной степени затруднено.

Рассмотрим молекулу, в которой две группы, А и В, соединены мостиком из двух СНг (метилековых)-групп. Если раздвинуть эти группы на максимально возможное расстояние, то молекула примет полностью вытянутую, или анги-конформацию:

А

ВиЬ вдоль линии связи межЪу атомами углвроЪа (проекция Ньюмена)

В такой молекуле не только группы А и В, но и все атомы водорода находятся на максимально возможном расстоянии один от другого. В этом легко убедиться, если взглянуть на молекулу вдоль оси, соединяющей атомы углерода (проекция Ньюмена). Поворот второго атома углерода на 180° вокруг одинарной связи переводит молекулу в заслоненную конформацию. Если группы А и В достаточно велики, они при таком повороте будут «наталкиваться» друг на друга, так что заслоненная конформация практически не сможет реализоваться—поворот вокруг упомянутой связи будет крайне затруднен. Даже если А и В — это просто атомы водорода (этан), переход к заслоненной конформации связан с преодолением вращательного барьера величиной до ~13 кДж-моль-1; он возникает из-за стерических затруднений при сближении атомов водорода [3] (это можно без труда продемонстрировать с помощью полных объемных моделей).

Заслоненная конформация

Если А и В — метильные группы (молекула бутана), стерические препятствия приводят к возникновению вращательного барьера около 25 кДж-моль-1 (~6 ккал-моль-1). Именно по этой причине во многих биологических молекулах цепочки из СНг-групп стремятся принять полностью вытянутую конформацию. Такого рода зигзагообразную структуру углеродной цепи можно обнаружить в полиэтилене, состоящем из длинных цепочек СНг-групп.

Помимо полностью вытянутой конформации возможны также две скошенные (гош-) конформации, которые почти так же устойчивы, как и анг«-конформация, и для которых стерические затруднения возникают лишь в том случае, если группы А и В очень велики. В одной из этих двух конформации группа В лежит справа от А, если смотреть вдоль

В

<р, торсионный угол ОЪна из двух скошенных конформации

оси молекулы, а в другой В оказывается слева от А. Данные конформации можно рассматривать по аналогии с правым и левым винтом (в обычных правых винтах нарезка, если смотреть на нее сверху вдоль оси — неважно с какого конца, — идет от наблюдателя слева направо, и точно таким же образом на рисунке показан переход от группы А к группе В). Угол ср — это торсионный угол. Для правых конформации он имеет положительное значение (правую конформацию называют также Р- или « + »-конформацией в отличие от М- или «—»-конформации, означающей левую конформацию). Скошенные конформации занимают важное место среди возможных конформации многих биологических молекул; например, молекула сахарного спирта рибита в кристаллах имеет вид серпа [4] —цепь сначала (слева) образует зигзаг, но затем, начиная с четвертого атома углерода, приобретает скошенную конформацию, что сводит к минимуму стерические затруднения, обусловлен

ные взаимодействием между ОН-группами при втором и четвертом атомах углерода.

Многие молекулы содержат кольца из 3, 4, 5, 6 и более атомов углерода. Если кольца, в кото

страница 31
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176

Скачать книгу "Биохимия. Химические реакции в живой клетке. Том 1" (5.5Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [прайс-листы]  [форум]  [обратная связь]

 

 

Реклама
взять напрокат ноутбук в москве
Компания Ренессанс: купить лестница на чердак раскладная - качественно и быстро!
кресло ch low v
Интернет-магазин КНС Нева предлагает Lexmark C748de - офис в Санкт-Петербурге, ул. Рузовская, д.11

Рекомендуемые книги

Введение в химию окружающей среды.

Книга известных английских ученых раскрывает основные принципы химии окружающей среды и их действие в локальных и глобальных масштабах. Важный аспект книги заключается в раскрытии механизма действия природных геохимических процессов в разных масштабах времени и влияния на них человеческой деятельности. Показываются химический состав, происхождение и эволюция земной коры, океанов и атмосферы. Детально рассматриваются процессы выветривания и их влияние на химический состав осадочных образований, почв и поверхностных вод на континентах. Для студентов и преподавателей факультетов биологии, географии и химии университетов и преподавателей средних школ, а также для широкого круга читателей.

Химия и технология редких и рассеянных элементов.

Книга представляет собой учебное пособие по специальным курсам для студентов химико-технологических вузов. В первой части изложены основы химии и технологии лития, рубидия, цезия, бериллия, галлия, индия, таллия. Во второй части книги изложены основы химии и технологии скандия, натрия, лантана, лантаноидов, германия, титана, циркония, гафния. В третьей части книги изложены основы химии и технологии ванадия, ниобия, тантала, селена, теллура, молибдена, вольфрама, рения. Наибольшее внимание уделено свойствам соединений элементов, имеющих значение в технологии. В технологии каждого элемента описаны важнейшие области применения, характеристика рудного сырья и его обогащение, получение соединений из концентратов и отходов производства, современные методы разделения и очистки элементов. Пособие составлено по материалам, опубликованным из советской и зарубежной печати по 1972 год включительно.

 

 



Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100

Copyright © 2001-2012
(11.12.2016)